Protein–RNA interactions for Protein: P05231

IL6, Interleukin-6, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL6P05231 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IL6P05231 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IL6P05231 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IL6P05231 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IL6P05231 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IL6P05231 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IL6P05231 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
IL6P05231 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IL6P05231 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IL6P05231 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IL6P05231 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IL6P05231 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
IL6P05231 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IL6P05231 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IL6P05231 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IL6P05231 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IL6P05231 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IL6P05231 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IL6P05231 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IL6P05231 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IL6P05231 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IL6P05231 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IL6P05231 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IL6P05231 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IL6P05231 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IL6P05231 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IL6P05231 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IL6P05231 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IL6P05231 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IL6P05231 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IL6P05231 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IL6P05231 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IL6P05231 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IL6P05231 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
IL6P05231 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
IL6P05231 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
IL6P05231 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
IL6P05231 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IL6P05231 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IL6P05231 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IL6P05231 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IL6P05231 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IL6P05231 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
IL6P05231 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IL6P05231 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IL6P05231 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IL6P05231 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IL6P05231 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IL6P05231 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IL6P05231 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IL6P05231 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IL6P05231 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IL6P05231 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IL6P05231 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IL6P05231 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IL6P05231 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IL6P05231 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IL6P05231 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IL6P05231 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
IL6P05231 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IL6P05231 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IL6P05231 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IL6P05231 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IL6P05231 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
IL6P05231 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IL6P05231 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IL6P05231 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IL6P05231 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IL6P05231 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
IL6P05231 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IL6P05231 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IL6P05231 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IL6P05231 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IL6P05231 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IL6P05231 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IL6P05231 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IL6P05231 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
IL6P05231 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IL6P05231 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IL6P05231 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IL6P05231 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IL6P05231 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IL6P05231 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IL6P05231 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IL6P05231 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IL6P05231 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IL6P05231 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IL6P05231 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IL6P05231 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IL6P05231 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IL6P05231 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IL6P05231 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IL6P05231 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IL6P05231 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IL6P05231 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IL6P05231 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IL6P05231 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
IL6P05231 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IL6P05231 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IL6P05231 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms