Protein–RNA interactions for Protein: P05000

IFNW1, Interferon omega-1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNW1P05000 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFNW1P05000 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFNW1P05000 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFNW1P05000 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFNW1P05000 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFNW1P05000 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFNW1P05000 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFNW1P05000 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFNW1P05000 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFNW1P05000 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFNW1P05000 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFNW1P05000 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFNW1P05000 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFNW1P05000 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFNW1P05000 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFNW1P05000 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFNW1P05000 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFNW1P05000 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFNW1P05000 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFNW1P05000 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFNW1P05000 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
IFNW1P05000 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFNW1P05000 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFNW1P05000 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFNW1P05000 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFNW1P05000 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IFNW1P05000 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFNW1P05000 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFNW1P05000 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFNW1P05000 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFNW1P05000 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFNW1P05000 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFNW1P05000 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFNW1P05000 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFNW1P05000 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFNW1P05000 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFNW1P05000 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFNW1P05000 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFNW1P05000 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFNW1P05000 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFNW1P05000 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
IFNW1P05000 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFNW1P05000 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFNW1P05000 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFNW1P05000 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFNW1P05000 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFNW1P05000 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFNW1P05000 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFNW1P05000 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFNW1P05000 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFNW1P05000 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFNW1P05000 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFNW1P05000 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFNW1P05000 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
IFNW1P05000 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFNW1P05000 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFNW1P05000 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFNW1P05000 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFNW1P05000 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFNW1P05000 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFNW1P05000 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFNW1P05000 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFNW1P05000 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IFNW1P05000 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IFNW1P05000 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IFNW1P05000 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
IFNW1P05000 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IFNW1P05000 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IFNW1P05000 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
IFNW1P05000 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
IFNW1P05000 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IFNW1P05000 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IFNW1P05000 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IFNW1P05000 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IFNW1P05000 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IFNW1P05000 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IFNW1P05000 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IFNW1P05000 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IFNW1P05000 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IFNW1P05000 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IFNW1P05000 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IFNW1P05000 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IFNW1P05000 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IFNW1P05000 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFNW1P05000 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFNW1P05000 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IFNW1P05000 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFNW1P05000 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFNW1P05000 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFNW1P05000 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFNW1P05000 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFNW1P05000 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFNW1P05000 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IFNW1P05000 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFNW1P05000 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFNW1P05000 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFNW1P05000 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IFNW1P05000 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFNW1P05000 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IFNW1P05000 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms