Protein–RNA interactions for Protein: P04844

RPN2, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPN2P04844 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPN2P04844 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPN2P04844 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPN2P04844 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPN2P04844 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPN2P04844 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPN2P04844 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPN2P04844 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RPN2P04844 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPN2P04844 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPN2P04844 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPN2P04844 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPN2P04844 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPN2P04844 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPN2P04844 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPN2P04844 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPN2P04844 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPN2P04844 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPN2P04844 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPN2P04844 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPN2P04844 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPN2P04844 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPN2P04844 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPN2P04844 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPN2P04844 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPN2P04844 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPN2P04844 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPN2P04844 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPN2P04844 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPN2P04844 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPN2P04844 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPN2P04844 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPN2P04844 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPN2P04844 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPN2P04844 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPN2P04844 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPN2P04844 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPN2P04844 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPN2P04844 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPN2P04844 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPN2P04844 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPN2P04844 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPN2P04844 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RPN2P04844 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPN2P04844 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPN2P04844 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RPN2P04844 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPN2P04844 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPN2P04844 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPN2P04844 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPN2P04844 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPN2P04844 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPN2P04844 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPN2P04844 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPN2P04844 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPN2P04844 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPN2P04844 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPN2P04844 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPN2P04844 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPN2P04844 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPN2P04844 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPN2P04844 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPN2P04844 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPN2P04844 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPN2P04844 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPN2P04844 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPN2P04844 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RPN2P04844 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RPN2P04844 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RPN2P04844 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RPN2P04844 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RPN2P04844 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPN2P04844 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPN2P04844 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPN2P04844 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPN2P04844 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPN2P04844 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RPN2P04844 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPN2P04844 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPN2P04844 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPN2P04844 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPN2P04844 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPN2P04844 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RPN2P04844 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPN2P04844 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RPN2P04844 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPN2P04844 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPN2P04844 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RPN2P04844 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPN2P04844 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPN2P04844 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RPN2P04844 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPN2P04844 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPN2P04844 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPN2P04844 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPN2P04844 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPN2P04844 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPN2P04844 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPN2P04844 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPN2P04844 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms