Protein–RNA interactions for Protein: P04217

A1BG, Alpha-1B-glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A1BGP04217 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
A1BGP04217 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
A1BGP04217 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
A1BGP04217 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
A1BGP04217 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
A1BGP04217 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
A1BGP04217 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
A1BGP04217 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
A1BGP04217 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
A1BGP04217 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
A1BGP04217 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
A1BGP04217 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
A1BGP04217 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
A1BGP04217 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
A1BGP04217 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
A1BGP04217 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
A1BGP04217 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
A1BGP04217 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
A1BGP04217 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
A1BGP04217 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
A1BGP04217 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
A1BGP04217 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
A1BGP04217 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
A1BGP04217 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
A1BGP04217 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
A1BGP04217 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
A1BGP04217 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
A1BGP04217 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
A1BGP04217 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
A1BGP04217 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
A1BGP04217 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
A1BGP04217 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
A1BGP04217 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
A1BGP04217 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
A1BGP04217 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
A1BGP04217 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
A1BGP04217 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
A1BGP04217 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
A1BGP04217 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
A1BGP04217 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
A1BGP04217 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
A1BGP04217 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
A1BGP04217 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
A1BGP04217 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
A1BGP04217 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
A1BGP04217 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
A1BGP04217 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
A1BGP04217 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
A1BGP04217 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
A1BGP04217 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
A1BGP04217 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
A1BGP04217 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
A1BGP04217 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
A1BGP04217 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
A1BGP04217 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
A1BGP04217 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
A1BGP04217 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
A1BGP04217 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
A1BGP04217 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
A1BGP04217 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
A1BGP04217 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
A1BGP04217 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
A1BGP04217 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
A1BGP04217 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
A1BGP04217 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
A1BGP04217 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
A1BGP04217 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
A1BGP04217 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
A1BGP04217 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
A1BGP04217 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
A1BGP04217 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
A1BGP04217 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
A1BGP04217 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
A1BGP04217 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
A1BGP04217 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
A1BGP04217 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC33.21■■■□□ 2.91
A1BGP04217 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
A1BGP04217 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC33.2■■■□□ 2.9
A1BGP04217 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
A1BGP04217 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC33.18■■■□□ 2.9
A1BGP04217 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
A1BGP04217 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
A1BGP04217 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
A1BGP04217 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
A1BGP04217 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
A1BGP04217 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
A1BGP04217 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
A1BGP04217 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
A1BGP04217 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
A1BGP04217 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
A1BGP04217 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
A1BGP04217 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
A1BGP04217 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
A1BGP04217 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
A1BGP04217 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
A1BGP04217 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
A1BGP04217 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
A1BGP04217 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
A1BGP04217 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
A1BGP04217 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.8 ms