Protein–RNA interactions for Protein: P04000

OPN1LW, Long-wave-sensitive opsin 1, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN1LWP04000 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
OPN1LWP04000 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OPN1LWP04000 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
OPN1LWP04000 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
OPN1LWP04000 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
OPN1LWP04000 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OPN1LWP04000 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
OPN1LWP04000 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
OPN1LWP04000 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OPN1LWP04000 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
OPN1LWP04000 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OPN1LWP04000 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
OPN1LWP04000 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
OPN1LWP04000 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
OPN1LWP04000 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
OPN1LWP04000 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
OPN1LWP04000 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
OPN1LWP04000 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
OPN1LWP04000 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
OPN1LWP04000 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
OPN1LWP04000 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
OPN1LWP04000 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
OPN1LWP04000 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
OPN1LWP04000 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
OPN1LWP04000 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OPN1LWP04000 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
OPN1LWP04000 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OPN1LWP04000 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OPN1LWP04000 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
OPN1LWP04000 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
OPN1LWP04000 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
OPN1LWP04000 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OPN1LWP04000 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
OPN1LWP04000 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OPN1LWP04000 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OPN1LWP04000 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OPN1LWP04000 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OPN1LWP04000 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OPN1LWP04000 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OPN1LWP04000 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OPN1LWP04000 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OPN1LWP04000 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OPN1LWP04000 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OPN1LWP04000 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OPN1LWP04000 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OPN1LWP04000 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OPN1LWP04000 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
OPN1LWP04000 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OPN1LWP04000 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OPN1LWP04000 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OPN1LWP04000 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OPN1LWP04000 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OPN1LWP04000 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OPN1LWP04000 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
OPN1LWP04000 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OPN1LWP04000 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OPN1LWP04000 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OPN1LWP04000 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OPN1LWP04000 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OPN1LWP04000 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OPN1LWP04000 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OPN1LWP04000 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OPN1LWP04000 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OPN1LWP04000 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OPN1LWP04000 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OPN1LWP04000 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OPN1LWP04000 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
OPN1LWP04000 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OPN1LWP04000 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OPN1LWP04000 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
OPN1LWP04000 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
OPN1LWP04000 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
OPN1LWP04000 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
OPN1LWP04000 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
OPN1LWP04000 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
OPN1LWP04000 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
OPN1LWP04000 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
OPN1LWP04000 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OPN1LWP04000 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OPN1LWP04000 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OPN1LWP04000 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OPN1LWP04000 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
OPN1LWP04000 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
OPN1LWP04000 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
OPN1LWP04000 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
OPN1LWP04000 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
OPN1LWP04000 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
OPN1LWP04000 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
OPN1LWP04000 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OPN1LWP04000 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
OPN1LWP04000 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
OPN1LWP04000 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
OPN1LWP04000 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
OPN1LWP04000 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
OPN1LWP04000 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
OPN1LWP04000 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OPN1LWP04000 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OPN1LWP04000 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
OPN1LWP04000 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
OPN1LWP04000 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms