Protein–RNA interactions for Protein: P01624

IGKV3-15, Immunoglobulin kappa variable 3-15, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV3-15P01624 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGKV3-15P01624 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGKV3-15P01624 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGKV3-15P01624 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGKV3-15P01624 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGKV3-15P01624 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGKV3-15P01624 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
IGKV3-15P01624 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
IGKV3-15P01624 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGKV3-15P01624 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGKV3-15P01624 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGKV3-15P01624 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGKV3-15P01624 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGKV3-15P01624 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGKV3-15P01624 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGKV3-15P01624 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGKV3-15P01624 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGKV3-15P01624 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
IGKV3-15P01624 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGKV3-15P01624 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
IGKV3-15P01624 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
IGKV3-15P01624 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGKV3-15P01624 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGKV3-15P01624 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGKV3-15P01624 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
IGKV3-15P01624 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGKV3-15P01624 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGKV3-15P01624 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGKV3-15P01624 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGKV3-15P01624 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGKV3-15P01624 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGKV3-15P01624 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGKV3-15P01624 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGKV3-15P01624 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGKV3-15P01624 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGKV3-15P01624 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGKV3-15P01624 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGKV3-15P01624 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGKV3-15P01624 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGKV3-15P01624 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGKV3-15P01624 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGKV3-15P01624 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGKV3-15P01624 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGKV3-15P01624 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
IGKV3-15P01624 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGKV3-15P01624 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGKV3-15P01624 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGKV3-15P01624 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGKV3-15P01624 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGKV3-15P01624 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
IGKV3-15P01624 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
IGKV3-15P01624 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGKV3-15P01624 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
IGKV3-15P01624 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGKV3-15P01624 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGKV3-15P01624 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGKV3-15P01624 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGKV3-15P01624 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGKV3-15P01624 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGKV3-15P01624 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGKV3-15P01624 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGKV3-15P01624 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGKV3-15P01624 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGKV3-15P01624 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGKV3-15P01624 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGKV3-15P01624 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGKV3-15P01624 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGKV3-15P01624 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGKV3-15P01624 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
IGKV3-15P01624 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IGKV3-15P01624 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IGKV3-15P01624 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IGKV3-15P01624 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IGKV3-15P01624 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IGKV3-15P01624 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IGKV3-15P01624 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IGKV3-15P01624 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
IGKV3-15P01624 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGKV3-15P01624 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGKV3-15P01624 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGKV3-15P01624 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGKV3-15P01624 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGKV3-15P01624 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGKV3-15P01624 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGKV3-15P01624 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGKV3-15P01624 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGKV3-15P01624 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGKV3-15P01624 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGKV3-15P01624 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGKV3-15P01624 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGKV3-15P01624 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
IGKV3-15P01624 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
IGKV3-15P01624 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
IGKV3-15P01624 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
IGKV3-15P01624 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
IGKV3-15P01624 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
IGKV3-15P01624 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
IGKV3-15P01624 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
IGKV3-15P01624 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
IGKV3-15P01624 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms