Protein–RNA interactions for Protein: P01599

IGKV1-17, Immunoglobulin kappa variable 1-17, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-17P01599 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGKV1-17P01599 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGKV1-17P01599 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGKV1-17P01599 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGKV1-17P01599 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGKV1-17P01599 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGKV1-17P01599 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
IGKV1-17P01599 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGKV1-17P01599 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGKV1-17P01599 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
IGKV1-17P01599 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGKV1-17P01599 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGKV1-17P01599 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGKV1-17P01599 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGKV1-17P01599 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGKV1-17P01599 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGKV1-17P01599 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGKV1-17P01599 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGKV1-17P01599 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGKV1-17P01599 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGKV1-17P01599 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGKV1-17P01599 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGKV1-17P01599 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGKV1-17P01599 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGKV1-17P01599 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
IGKV1-17P01599 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGKV1-17P01599 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
IGKV1-17P01599 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IGKV1-17P01599 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGKV1-17P01599 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGKV1-17P01599 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGKV1-17P01599 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGKV1-17P01599 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IGKV1-17P01599 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IGKV1-17P01599 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IGKV1-17P01599 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IGKV1-17P01599 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IGKV1-17P01599 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IGKV1-17P01599 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IGKV1-17P01599 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IGKV1-17P01599 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IGKV1-17P01599 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IGKV1-17P01599 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IGKV1-17P01599 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IGKV1-17P01599 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IGKV1-17P01599 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IGKV1-17P01599 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IGKV1-17P01599 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IGKV1-17P01599 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IGKV1-17P01599 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IGKV1-17P01599 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IGKV1-17P01599 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IGKV1-17P01599 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IGKV1-17P01599 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IGKV1-17P01599 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
IGKV1-17P01599 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
IGKV1-17P01599 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IGKV1-17P01599 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IGKV1-17P01599 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IGKV1-17P01599 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IGKV1-17P01599 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
IGKV1-17P01599 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IGKV1-17P01599 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IGKV1-17P01599 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IGKV1-17P01599 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IGKV1-17P01599 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IGKV1-17P01599 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IGKV1-17P01599 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IGKV1-17P01599 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IGKV1-17P01599 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IGKV1-17P01599 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IGKV1-17P01599 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IGKV1-17P01599 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IGKV1-17P01599 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IGKV1-17P01599 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IGKV1-17P01599 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IGKV1-17P01599 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IGKV1-17P01599 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IGKV1-17P01599 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IGKV1-17P01599 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IGKV1-17P01599 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IGKV1-17P01599 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IGKV1-17P01599 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IGKV1-17P01599 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IGKV1-17P01599 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IGKV1-17P01599 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IGKV1-17P01599 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IGKV1-17P01599 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IGKV1-17P01599 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IGKV1-17P01599 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IGKV1-17P01599 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
IGKV1-17P01599 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IGKV1-17P01599 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IGKV1-17P01599 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IGKV1-17P01599 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IGKV1-17P01599 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IGKV1-17P01599 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
IGKV1-17P01599 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IGKV1-17P01599 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IGKV1-17P01599 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms