Protein–RNA interactions for Protein: P01189

POMC, Pro-opiomelanocortin, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMCP01189 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
POMCP01189 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
POMCP01189 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
POMCP01189 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
POMCP01189 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
POMCP01189 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
POMCP01189 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
POMCP01189 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
POMCP01189 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
POMCP01189 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
POMCP01189 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
POMCP01189 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
POMCP01189 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
POMCP01189 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
POMCP01189 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
POMCP01189 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
POMCP01189 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
POMCP01189 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
POMCP01189 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
POMCP01189 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
POMCP01189 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
POMCP01189 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
POMCP01189 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
POMCP01189 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
POMCP01189 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
POMCP01189 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
POMCP01189 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
POMCP01189 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
POMCP01189 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
POMCP01189 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
POMCP01189 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
POMCP01189 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
POMCP01189 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
POMCP01189 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
POMCP01189 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
POMCP01189 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
POMCP01189 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
POMCP01189 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
POMCP01189 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
POMCP01189 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
POMCP01189 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
POMCP01189 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
POMCP01189 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
POMCP01189 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
POMCP01189 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
POMCP01189 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
POMCP01189 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
POMCP01189 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
POMCP01189 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
POMCP01189 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28■■■□□ 2.07
POMCP01189 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
POMCP01189 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
POMCP01189 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
POMCP01189 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
POMCP01189 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
POMCP01189 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
POMCP01189 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
POMCP01189 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
POMCP01189 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
POMCP01189 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
POMCP01189 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
POMCP01189 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
POMCP01189 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
POMCP01189 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
POMCP01189 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
POMCP01189 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
POMCP01189 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
POMCP01189 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
POMCP01189 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
POMCP01189 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
POMCP01189 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
POMCP01189 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
POMCP01189 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
POMCP01189 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
POMCP01189 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
POMCP01189 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
POMCP01189 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
POMCP01189 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
POMCP01189 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
POMCP01189 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
POMCP01189 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
POMCP01189 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
POMCP01189 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
POMCP01189 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
POMCP01189 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
POMCP01189 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
POMCP01189 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
POMCP01189 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
POMCP01189 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
POMCP01189 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
POMCP01189 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
POMCP01189 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
POMCP01189 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
POMCP01189 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
POMCP01189 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
POMCP01189 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
POMCP01189 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
POMCP01189 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
POMCP01189 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
POMCP01189 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms