Protein–RNA interactions for Protein: P01138

NGF, Beta-nerve growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFP01138 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NGFP01138 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NGFP01138 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NGFP01138 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NGFP01138 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NGFP01138 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NGFP01138 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NGFP01138 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NGFP01138 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NGFP01138 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NGFP01138 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NGFP01138 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NGFP01138 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NGFP01138 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NGFP01138 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NGFP01138 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NGFP01138 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NGFP01138 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NGFP01138 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NGFP01138 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NGFP01138 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NGFP01138 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NGFP01138 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NGFP01138 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NGFP01138 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NGFP01138 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NGFP01138 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NGFP01138 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NGFP01138 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NGFP01138 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NGFP01138 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NGFP01138 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NGFP01138 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NGFP01138 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NGFP01138 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NGFP01138 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NGFP01138 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NGFP01138 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NGFP01138 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NGFP01138 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NGFP01138 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NGFP01138 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NGFP01138 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NGFP01138 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NGFP01138 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NGFP01138 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NGFP01138 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NGFP01138 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NGFP01138 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NGFP01138 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NGFP01138 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NGFP01138 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NGFP01138 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NGFP01138 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NGFP01138 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NGFP01138 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NGFP01138 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NGFP01138 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NGFP01138 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NGFP01138 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NGFP01138 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NGFP01138 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NGFP01138 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NGFP01138 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NGFP01138 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NGFP01138 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NGFP01138 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NGFP01138 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NGFP01138 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NGFP01138 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NGFP01138 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NGFP01138 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NGFP01138 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NGFP01138 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NGFP01138 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NGFP01138 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NGFP01138 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NGFP01138 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NGFP01138 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NGFP01138 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NGFP01138 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NGFP01138 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NGFP01138 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NGFP01138 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NGFP01138 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NGFP01138 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NGFP01138 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NGFP01138 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NGFP01138 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NGFP01138 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NGFP01138 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NGFP01138 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NGFP01138 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NGFP01138 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NGFP01138 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NGFP01138 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NGFP01138 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NGFP01138 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NGFP01138 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NGFP01138 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms