Protein–RNA interactions for Protein: P01040

CSTA, Cystatin-A, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTAP01040 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSTAP01040 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSTAP01040 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSTAP01040 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSTAP01040 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSTAP01040 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSTAP01040 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSTAP01040 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSTAP01040 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSTAP01040 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSTAP01040 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CSTAP01040 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CSTAP01040 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CSTAP01040 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CSTAP01040 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CSTAP01040 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSTAP01040 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSTAP01040 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CSTAP01040 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSTAP01040 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSTAP01040 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CSTAP01040 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSTAP01040 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CSTAP01040 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSTAP01040 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSTAP01040 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSTAP01040 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSTAP01040 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSTAP01040 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSTAP01040 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CSTAP01040 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CSTAP01040 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CSTAP01040 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CSTAP01040 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSTAP01040 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSTAP01040 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CSTAP01040 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSTAP01040 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSTAP01040 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSTAP01040 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSTAP01040 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSTAP01040 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSTAP01040 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSTAP01040 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSTAP01040 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSTAP01040 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSTAP01040 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSTAP01040 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSTAP01040 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSTAP01040 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CSTAP01040 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSTAP01040 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSTAP01040 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSTAP01040 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CSTAP01040 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSTAP01040 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSTAP01040 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSTAP01040 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSTAP01040 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSTAP01040 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSTAP01040 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSTAP01040 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSTAP01040 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSTAP01040 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSTAP01040 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSTAP01040 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSTAP01040 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSTAP01040 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSTAP01040 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSTAP01040 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSTAP01040 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSTAP01040 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSTAP01040 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSTAP01040 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSTAP01040 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSTAP01040 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSTAP01040 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSTAP01040 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSTAP01040 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSTAP01040 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSTAP01040 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSTAP01040 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSTAP01040 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSTAP01040 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSTAP01040 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSTAP01040 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSTAP01040 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CSTAP01040 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSTAP01040 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSTAP01040 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSTAP01040 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSTAP01040 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSTAP01040 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CSTAP01040 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSTAP01040 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSTAP01040 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSTAP01040 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CSTAP01040 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSTAP01040 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSTAP01040 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms