Protein–RNA interactions for Protein: P00519

ABL1, Tyrosine-protein kinase ABL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABL1P00519 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ABL1P00519 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ABL1P00519 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ABL1P00519 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABL1P00519 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABL1P00519 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ABL1P00519 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABL1P00519 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ABL1P00519 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ABL1P00519 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ABL1P00519 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ABL1P00519 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ABL1P00519 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ABL1P00519 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ABL1P00519 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ABL1P00519 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ABL1P00519 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ABL1P00519 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABL1P00519 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ABL1P00519 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ABL1P00519 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ABL1P00519 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ABL1P00519 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ABL1P00519 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ABL1P00519 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ABL1P00519 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ABL1P00519 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
ABL1P00519 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ABL1P00519 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ABL1P00519 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ABL1P00519 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ABL1P00519 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ABL1P00519 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ABL1P00519 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
ABL1P00519 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABL1P00519 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABL1P00519 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABL1P00519 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABL1P00519 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABL1P00519 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABL1P00519 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABL1P00519 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABL1P00519 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABL1P00519 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABL1P00519 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABL1P00519 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABL1P00519 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABL1P00519 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ABL1P00519 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABL1P00519 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABL1P00519 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ABL1P00519 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABL1P00519 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABL1P00519 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABL1P00519 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABL1P00519 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABL1P00519 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ABL1P00519 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABL1P00519 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABL1P00519 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ABL1P00519 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABL1P00519 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABL1P00519 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABL1P00519 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABL1P00519 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABL1P00519 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABL1P00519 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABL1P00519 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABL1P00519 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABL1P00519 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABL1P00519 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABL1P00519 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABL1P00519 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABL1P00519 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABL1P00519 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ABL1P00519 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ABL1P00519 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ABL1P00519 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ABL1P00519 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ABL1P00519 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
ABL1P00519 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABL1P00519 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ABL1P00519 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABL1P00519 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABL1P00519 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ABL1P00519 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABL1P00519 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABL1P00519 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABL1P00519 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABL1P00519 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABL1P00519 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABL1P00519 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ABL1P00519 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ABL1P00519 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ABL1P00519 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABL1P00519 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABL1P00519 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ABL1P00519 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABL1P00519 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABL1P00519 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms