Protein–RNA interactions for Protein: O95803

NDST3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST3O95803 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NDST3O95803 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NDST3O95803 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NDST3O95803 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NDST3O95803 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
NDST3O95803 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NDST3O95803 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NDST3O95803 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NDST3O95803 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NDST3O95803 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NDST3O95803 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NDST3O95803 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NDST3O95803 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NDST3O95803 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NDST3O95803 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NDST3O95803 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NDST3O95803 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NDST3O95803 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NDST3O95803 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NDST3O95803 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NDST3O95803 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NDST3O95803 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NDST3O95803 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NDST3O95803 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NDST3O95803 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NDST3O95803 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NDST3O95803 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NDST3O95803 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NDST3O95803 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NDST3O95803 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NDST3O95803 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NDST3O95803 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NDST3O95803 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NDST3O95803 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NDST3O95803 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NDST3O95803 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NDST3O95803 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
NDST3O95803 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NDST3O95803 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NDST3O95803 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NDST3O95803 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NDST3O95803 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NDST3O95803 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NDST3O95803 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NDST3O95803 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NDST3O95803 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NDST3O95803 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NDST3O95803 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NDST3O95803 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NDST3O95803 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NDST3O95803 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NDST3O95803 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NDST3O95803 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NDST3O95803 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NDST3O95803 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NDST3O95803 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
NDST3O95803 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NDST3O95803 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NDST3O95803 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NDST3O95803 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NDST3O95803 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NDST3O95803 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NDST3O95803 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NDST3O95803 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NDST3O95803 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NDST3O95803 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NDST3O95803 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NDST3O95803 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NDST3O95803 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NDST3O95803 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NDST3O95803 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NDST3O95803 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NDST3O95803 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NDST3O95803 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NDST3O95803 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NDST3O95803 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NDST3O95803 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NDST3O95803 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NDST3O95803 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NDST3O95803 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NDST3O95803 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NDST3O95803 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NDST3O95803 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NDST3O95803 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NDST3O95803 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NDST3O95803 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NDST3O95803 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NDST3O95803 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NDST3O95803 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NDST3O95803 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NDST3O95803 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NDST3O95803 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NDST3O95803 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NDST3O95803 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NDST3O95803 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NDST3O95803 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NDST3O95803 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NDST3O95803 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NDST3O95803 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NDST3O95803 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms