Protein–RNA interactions for Protein: O95503

CBX6, Chromobox protein homolog 6, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX6O95503 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CBX6O95503 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CBX6O95503 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CBX6O95503 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CBX6O95503 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CBX6O95503 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CBX6O95503 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CBX6O95503 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CBX6O95503 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CBX6O95503 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CBX6O95503 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CBX6O95503 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CBX6O95503 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CBX6O95503 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CBX6O95503 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CBX6O95503 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CBX6O95503 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CBX6O95503 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CBX6O95503 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CBX6O95503 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CBX6O95503 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CBX6O95503 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CBX6O95503 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CBX6O95503 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CBX6O95503 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CBX6O95503 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CBX6O95503 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CBX6O95503 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CBX6O95503 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CBX6O95503 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CBX6O95503 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CBX6O95503 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CBX6O95503 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CBX6O95503 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CBX6O95503 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CBX6O95503 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CBX6O95503 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CBX6O95503 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CBX6O95503 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CBX6O95503 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CBX6O95503 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CBX6O95503 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CBX6O95503 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CBX6O95503 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CBX6O95503 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CBX6O95503 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CBX6O95503 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CBX6O95503 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CBX6O95503 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CBX6O95503 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CBX6O95503 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CBX6O95503 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CBX6O95503 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CBX6O95503 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CBX6O95503 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CBX6O95503 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CBX6O95503 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CBX6O95503 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CBX6O95503 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CBX6O95503 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CBX6O95503 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CBX6O95503 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CBX6O95503 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CBX6O95503 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CBX6O95503 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CBX6O95503 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CBX6O95503 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CBX6O95503 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CBX6O95503 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CBX6O95503 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CBX6O95503 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CBX6O95503 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CBX6O95503 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CBX6O95503 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CBX6O95503 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CBX6O95503 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CBX6O95503 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CBX6O95503 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CBX6O95503 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CBX6O95503 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CBX6O95503 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CBX6O95503 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CBX6O95503 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CBX6O95503 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CBX6O95503 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CBX6O95503 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CBX6O95503 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CBX6O95503 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CBX6O95503 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CBX6O95503 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CBX6O95503 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CBX6O95503 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CBX6O95503 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CBX6O95503 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CBX6O95503 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CBX6O95503 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CBX6O95503 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CBX6O95503 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CBX6O95503 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CBX6O95503 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms