Protein–RNA interactions for Protein: O95425

SVIL, Supervillin, humanhuman

Predictions only

Length 2,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVILO95425 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SVILO95425 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SVILO95425 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SVILO95425 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SVILO95425 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SVILO95425 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SVILO95425 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SVILO95425 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SVILO95425 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SVILO95425 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SVILO95425 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SVILO95425 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SVILO95425 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SVILO95425 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SVILO95425 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SVILO95425 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SVILO95425 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SVILO95425 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SVILO95425 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SVILO95425 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SVILO95425 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SVILO95425 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SVILO95425 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SVILO95425 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SVILO95425 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SVILO95425 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SVILO95425 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SVILO95425 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SVILO95425 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SVILO95425 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SVILO95425 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SVILO95425 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SVILO95425 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SVILO95425 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SVILO95425 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SVILO95425 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SVILO95425 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SVILO95425 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SVILO95425 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SVILO95425 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SVILO95425 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SVILO95425 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SVILO95425 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SVILO95425 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SVILO95425 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SVILO95425 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SVILO95425 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SVILO95425 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SVILO95425 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SVILO95425 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SVILO95425 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SVILO95425 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SVILO95425 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SVILO95425 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SVILO95425 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SVILO95425 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SVILO95425 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SVILO95425 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SVILO95425 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SVILO95425 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SVILO95425 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SVILO95425 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SVILO95425 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SVILO95425 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SVILO95425 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SVILO95425 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SVILO95425 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SVILO95425 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SVILO95425 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SVILO95425 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SVILO95425 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SVILO95425 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SVILO95425 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SVILO95425 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SVILO95425 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SVILO95425 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SVILO95425 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SVILO95425 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SVILO95425 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SVILO95425 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SVILO95425 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SVILO95425 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SVILO95425 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SVILO95425 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SVILO95425 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SVILO95425 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SVILO95425 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SVILO95425 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SVILO95425 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SVILO95425 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SVILO95425 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SVILO95425 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SVILO95425 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SVILO95425 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SVILO95425 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SVILO95425 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SVILO95425 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SVILO95425 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SVILO95425 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SVILO95425 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms