Protein–RNA interactions for Protein: O95171

SCEL, Sciellin, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCELO95171 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCELO95171 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCELO95171 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCELO95171 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCELO95171 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SCELO95171 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCELO95171 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCELO95171 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCELO95171 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCELO95171 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCELO95171 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCELO95171 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCELO95171 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCELO95171 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCELO95171 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCELO95171 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCELO95171 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCELO95171 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCELO95171 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCELO95171 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCELO95171 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCELO95171 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCELO95171 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCELO95171 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCELO95171 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCELO95171 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCELO95171 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCELO95171 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCELO95171 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCELO95171 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCELO95171 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCELO95171 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SCELO95171 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
SCELO95171 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCELO95171 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCELO95171 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCELO95171 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCELO95171 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCELO95171 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCELO95171 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCELO95171 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCELO95171 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCELO95171 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCELO95171 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCELO95171 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCELO95171 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCELO95171 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCELO95171 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCELO95171 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCELO95171 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCELO95171 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCELO95171 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCELO95171 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCELO95171 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCELO95171 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCELO95171 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCELO95171 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SCELO95171 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCELO95171 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCELO95171 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCELO95171 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCELO95171 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCELO95171 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCELO95171 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCELO95171 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SCELO95171 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCELO95171 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCELO95171 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCELO95171 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCELO95171 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCELO95171 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCELO95171 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCELO95171 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCELO95171 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCELO95171 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SCELO95171 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SCELO95171 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCELO95171 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SCELO95171 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCELO95171 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCELO95171 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCELO95171 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCELO95171 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCELO95171 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCELO95171 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SCELO95171 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCELO95171 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCELO95171 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCELO95171 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCELO95171 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCELO95171 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCELO95171 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCELO95171 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCELO95171 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCELO95171 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCELO95171 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SCELO95171 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCELO95171 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCELO95171 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCELO95171 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms