Protein–RNA interactions for Protein: O94979

SEC31A, Protein transport protein Sec31A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31AO94979 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SEC31AO94979 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SEC31AO94979 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SEC31AO94979 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SEC31AO94979 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SEC31AO94979 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SEC31AO94979 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SEC31AO94979 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SEC31AO94979 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SEC31AO94979 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SEC31AO94979 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SEC31AO94979 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SEC31AO94979 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SEC31AO94979 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SEC31AO94979 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SEC31AO94979 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SEC31AO94979 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SEC31AO94979 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SEC31AO94979 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SEC31AO94979 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SEC31AO94979 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SEC31AO94979 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SEC31AO94979 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SEC31AO94979 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SEC31AO94979 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SEC31AO94979 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SEC31AO94979 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SEC31AO94979 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SEC31AO94979 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SEC31AO94979 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SEC31AO94979 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SEC31AO94979 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SEC31AO94979 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SEC31AO94979 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SEC31AO94979 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SEC31AO94979 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SEC31AO94979 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SEC31AO94979 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SEC31AO94979 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SEC31AO94979 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SEC31AO94979 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SEC31AO94979 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SEC31AO94979 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SEC31AO94979 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SEC31AO94979 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SEC31AO94979 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SEC31AO94979 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SEC31AO94979 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SEC31AO94979 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SEC31AO94979 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SEC31AO94979 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SEC31AO94979 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SEC31AO94979 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SEC31AO94979 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SEC31AO94979 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SEC31AO94979 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SEC31AO94979 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SEC31AO94979 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SEC31AO94979 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SEC31AO94979 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SEC31AO94979 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SEC31AO94979 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SEC31AO94979 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SEC31AO94979 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SEC31AO94979 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SEC31AO94979 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SEC31AO94979 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SEC31AO94979 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SEC31AO94979 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SEC31AO94979 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SEC31AO94979 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SEC31AO94979 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SEC31AO94979 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SEC31AO94979 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SEC31AO94979 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SEC31AO94979 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SEC31AO94979 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SEC31AO94979 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SEC31AO94979 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SEC31AO94979 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SEC31AO94979 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SEC31AO94979 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SEC31AO94979 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SEC31AO94979 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SEC31AO94979 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEC31AO94979 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEC31AO94979 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEC31AO94979 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEC31AO94979 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEC31AO94979 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEC31AO94979 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEC31AO94979 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEC31AO94979 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEC31AO94979 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEC31AO94979 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEC31AO94979 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEC31AO94979 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEC31AO94979 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEC31AO94979 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SEC31AO94979 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms