Protein–RNA interactions for Protein: O94782

USP1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP1O94782 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP1O94782 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
USP1O94782 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP1O94782 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP1O94782 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP1O94782 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP1O94782 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP1O94782 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP1O94782 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP1O94782 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP1O94782 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP1O94782 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP1O94782 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP1O94782 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP1O94782 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP1O94782 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
USP1O94782 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP1O94782 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP1O94782 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP1O94782 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP1O94782 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP1O94782 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
USP1O94782 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP1O94782 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP1O94782 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
USP1O94782 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
USP1O94782 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP1O94782 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP1O94782 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP1O94782 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP1O94782 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP1O94782 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP1O94782 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP1O94782 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP1O94782 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP1O94782 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP1O94782 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP1O94782 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP1O94782 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP1O94782 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP1O94782 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP1O94782 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
USP1O94782 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
USP1O94782 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP1O94782 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP1O94782 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP1O94782 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP1O94782 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP1O94782 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP1O94782 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP1O94782 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP1O94782 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP1O94782 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP1O94782 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP1O94782 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP1O94782 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP1O94782 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP1O94782 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP1O94782 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP1O94782 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP1O94782 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP1O94782 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP1O94782 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP1O94782 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP1O94782 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP1O94782 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
USP1O94782 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP1O94782 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP1O94782 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
USP1O94782 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP1O94782 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP1O94782 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP1O94782 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP1O94782 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP1O94782 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP1O94782 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP1O94782 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP1O94782 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP1O94782 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP1O94782 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP1O94782 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
USP1O94782 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP1O94782 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP1O94782 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP1O94782 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP1O94782 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP1O94782 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
USP1O94782 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
USP1O94782 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP1O94782 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP1O94782 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP1O94782 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP1O94782 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP1O94782 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP1O94782 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP1O94782 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP1O94782 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP1O94782 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP1O94782 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP1O94782 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms