Protein–RNA interactions for Protein: O76015

KRT38, Keratin, type I cuticular Ha8, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT38O76015 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT38O76015 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT38O76015 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT38O76015 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT38O76015 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT38O76015 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT38O76015 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT38O76015 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT38O76015 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT38O76015 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT38O76015 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT38O76015 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT38O76015 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT38O76015 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT38O76015 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT38O76015 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT38O76015 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT38O76015 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT38O76015 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT38O76015 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT38O76015 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT38O76015 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT38O76015 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT38O76015 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT38O76015 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KRT38O76015 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT38O76015 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT38O76015 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT38O76015 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT38O76015 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT38O76015 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT38O76015 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT38O76015 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT38O76015 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT38O76015 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT38O76015 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT38O76015 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT38O76015 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT38O76015 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT38O76015 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT38O76015 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT38O76015 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT38O76015 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT38O76015 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT38O76015 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT38O76015 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT38O76015 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT38O76015 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT38O76015 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT38O76015 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
KRT38O76015 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
KRT38O76015 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT38O76015 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT38O76015 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT38O76015 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT38O76015 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT38O76015 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT38O76015 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT38O76015 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT38O76015 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT38O76015 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT38O76015 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT38O76015 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT38O76015 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT38O76015 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT38O76015 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT38O76015 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT38O76015 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT38O76015 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT38O76015 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT38O76015 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT38O76015 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT38O76015 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT38O76015 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT38O76015 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT38O76015 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT38O76015 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT38O76015 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT38O76015 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT38O76015 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT38O76015 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT38O76015 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT38O76015 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT38O76015 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT38O76015 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT38O76015 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT38O76015 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT38O76015 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT38O76015 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT38O76015 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT38O76015 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT38O76015 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT38O76015 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT38O76015 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT38O76015 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT38O76015 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT38O76015 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT38O76015 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT38O76015 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT38O76015 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms