Protein–RNA interactions for Protein: O75973

C1QL1, C1q-related factor, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QL1O75973 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1QL1O75973 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
C1QL1O75973 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C1QL1O75973 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C1QL1O75973 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1QL1O75973 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1QL1O75973 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C1QL1O75973 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C1QL1O75973 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
C1QL1O75973 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1QL1O75973 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1QL1O75973 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
C1QL1O75973 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1QL1O75973 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1QL1O75973 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1QL1O75973 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C1QL1O75973 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C1QL1O75973 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C1QL1O75973 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C1QL1O75973 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
C1QL1O75973 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
C1QL1O75973 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C1QL1O75973 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
C1QL1O75973 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C1QL1O75973 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C1QL1O75973 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C1QL1O75973 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1QL1O75973 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1QL1O75973 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C1QL1O75973 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C1QL1O75973 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C1QL1O75973 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C1QL1O75973 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C1QL1O75973 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1QL1O75973 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1QL1O75973 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
C1QL1O75973 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1QL1O75973 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1QL1O75973 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C1QL1O75973 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C1QL1O75973 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C1QL1O75973 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
C1QL1O75973 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1QL1O75973 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1QL1O75973 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1QL1O75973 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1QL1O75973 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1QL1O75973 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1QL1O75973 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C1QL1O75973 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C1QL1O75973 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C1QL1O75973 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1QL1O75973 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1QL1O75973 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1QL1O75973 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1QL1O75973 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1QL1O75973 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C1QL1O75973 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C1QL1O75973 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C1QL1O75973 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1QL1O75973 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1QL1O75973 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1QL1O75973 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1QL1O75973 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1QL1O75973 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1QL1O75973 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1QL1O75973 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C1QL1O75973 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C1QL1O75973 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C1QL1O75973 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C1QL1O75973 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C1QL1O75973 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C1QL1O75973 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C1QL1O75973 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C1QL1O75973 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C1QL1O75973 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C1QL1O75973 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1QL1O75973 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1QL1O75973 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1QL1O75973 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1QL1O75973 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1QL1O75973 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1QL1O75973 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C1QL1O75973 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C1QL1O75973 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C1QL1O75973 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C1QL1O75973 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C1QL1O75973 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
C1QL1O75973 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C1QL1O75973 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
C1QL1O75973 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C1QL1O75973 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C1QL1O75973 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C1QL1O75973 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C1QL1O75973 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C1QL1O75973 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
C1QL1O75973 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C1QL1O75973 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C1QL1O75973 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C1QL1O75973 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms