Protein–RNA interactions for Protein: O75956

CDK2AP2, Cyclin-dependent kinase 2-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK2AP2O75956 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDK2AP2O75956 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK2AP2O75956 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK2AP2O75956 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK2AP2O75956 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDK2AP2O75956 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK2AP2O75956 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK2AP2O75956 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDK2AP2O75956 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK2AP2O75956 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK2AP2O75956 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK2AP2O75956 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK2AP2O75956 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK2AP2O75956 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK2AP2O75956 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK2AP2O75956 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK2AP2O75956 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK2AP2O75956 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK2AP2O75956 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK2AP2O75956 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK2AP2O75956 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK2AP2O75956 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK2AP2O75956 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK2AP2O75956 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK2AP2O75956 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK2AP2O75956 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK2AP2O75956 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK2AP2O75956 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK2AP2O75956 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK2AP2O75956 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK2AP2O75956 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK2AP2O75956 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK2AP2O75956 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK2AP2O75956 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK2AP2O75956 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK2AP2O75956 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK2AP2O75956 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDK2AP2O75956 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK2AP2O75956 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK2AP2O75956 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDK2AP2O75956 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDK2AP2O75956 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK2AP2O75956 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK2AP2O75956 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK2AP2O75956 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK2AP2O75956 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK2AP2O75956 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK2AP2O75956 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK2AP2O75956 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK2AP2O75956 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK2AP2O75956 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK2AP2O75956 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK2AP2O75956 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK2AP2O75956 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK2AP2O75956 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK2AP2O75956 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK2AP2O75956 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK2AP2O75956 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK2AP2O75956 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK2AP2O75956 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK2AP2O75956 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK2AP2O75956 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK2AP2O75956 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK2AP2O75956 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK2AP2O75956 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK2AP2O75956 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK2AP2O75956 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK2AP2O75956 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK2AP2O75956 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK2AP2O75956 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK2AP2O75956 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK2AP2O75956 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK2AP2O75956 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK2AP2O75956 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CDK2AP2O75956 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CDK2AP2O75956 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CDK2AP2O75956 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK2AP2O75956 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK2AP2O75956 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK2AP2O75956 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK2AP2O75956 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK2AP2O75956 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK2AP2O75956 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK2AP2O75956 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK2AP2O75956 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK2AP2O75956 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK2AP2O75956 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK2AP2O75956 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK2AP2O75956 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK2AP2O75956 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK2AP2O75956 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK2AP2O75956 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDK2AP2O75956 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDK2AP2O75956 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDK2AP2O75956 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDK2AP2O75956 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDK2AP2O75956 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDK2AP2O75956 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDK2AP2O75956 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDK2AP2O75956 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms