Protein–RNA interactions for Protein: O75603

GCM2, Chorion-specific transcription factor GCMb, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCM2O75603 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GCM2O75603 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GCM2O75603 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCM2O75603 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GCM2O75603 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GCM2O75603 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCM2O75603 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCM2O75603 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCM2O75603 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCM2O75603 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCM2O75603 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCM2O75603 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCM2O75603 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCM2O75603 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCM2O75603 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCM2O75603 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCM2O75603 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCM2O75603 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCM2O75603 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCM2O75603 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCM2O75603 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCM2O75603 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCM2O75603 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCM2O75603 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCM2O75603 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCM2O75603 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCM2O75603 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCM2O75603 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCM2O75603 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCM2O75603 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCM2O75603 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCM2O75603 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCM2O75603 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCM2O75603 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCM2O75603 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCM2O75603 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCM2O75603 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GCM2O75603 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GCM2O75603 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GCM2O75603 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCM2O75603 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCM2O75603 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCM2O75603 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCM2O75603 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCM2O75603 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCM2O75603 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GCM2O75603 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GCM2O75603 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GCM2O75603 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GCM2O75603 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GCM2O75603 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GCM2O75603 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GCM2O75603 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
GCM2O75603 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GCM2O75603 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GCM2O75603 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GCM2O75603 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GCM2O75603 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GCM2O75603 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GCM2O75603 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCM2O75603 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCM2O75603 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCM2O75603 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCM2O75603 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCM2O75603 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCM2O75603 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GCM2O75603 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCM2O75603 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCM2O75603 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCM2O75603 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCM2O75603 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCM2O75603 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCM2O75603 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCM2O75603 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCM2O75603 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCM2O75603 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCM2O75603 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCM2O75603 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCM2O75603 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCM2O75603 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCM2O75603 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
GCM2O75603 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
GCM2O75603 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCM2O75603 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCM2O75603 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCM2O75603 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GCM2O75603 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GCM2O75603 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GCM2O75603 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCM2O75603 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCM2O75603 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCM2O75603 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCM2O75603 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCM2O75603 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCM2O75603 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GCM2O75603 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GCM2O75603 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCM2O75603 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCM2O75603 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCM2O75603 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 250.6 ms