Protein–RNA interactions for Protein: O75575

CRCP, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC9, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRCPO75575 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRCPO75575 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRCPO75575 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRCPO75575 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CRCPO75575 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRCPO75575 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRCPO75575 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRCPO75575 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRCPO75575 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRCPO75575 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRCPO75575 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRCPO75575 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRCPO75575 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRCPO75575 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRCPO75575 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRCPO75575 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRCPO75575 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRCPO75575 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRCPO75575 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CRCPO75575 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRCPO75575 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRCPO75575 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRCPO75575 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRCPO75575 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRCPO75575 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRCPO75575 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRCPO75575 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRCPO75575 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRCPO75575 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRCPO75575 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRCPO75575 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRCPO75575 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRCPO75575 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRCPO75575 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CRCPO75575 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CRCPO75575 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CRCPO75575 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CRCPO75575 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRCPO75575 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRCPO75575 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRCPO75575 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRCPO75575 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRCPO75575 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRCPO75575 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRCPO75575 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRCPO75575 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRCPO75575 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CRCPO75575 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRCPO75575 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRCPO75575 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRCPO75575 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRCPO75575 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRCPO75575 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRCPO75575 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRCPO75575 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRCPO75575 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRCPO75575 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRCPO75575 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CRCPO75575 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRCPO75575 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRCPO75575 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRCPO75575 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRCPO75575 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRCPO75575 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CRCPO75575 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRCPO75575 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CRCPO75575 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CRCPO75575 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CRCPO75575 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CRCPO75575 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CRCPO75575 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRCPO75575 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRCPO75575 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRCPO75575 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRCPO75575 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRCPO75575 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRCPO75575 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRCPO75575 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRCPO75575 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CRCPO75575 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRCPO75575 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRCPO75575 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CRCPO75575 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRCPO75575 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRCPO75575 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRCPO75575 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRCPO75575 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRCPO75575 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRCPO75575 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRCPO75575 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRCPO75575 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRCPO75575 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRCPO75575 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRCPO75575 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRCPO75575 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRCPO75575 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRCPO75575 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRCPO75575 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRCPO75575 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CRCPO75575 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms