Protein–RNA interactions for Protein: O75569

PRKRA, Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRAO75569 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKRAO75569 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKRAO75569 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKRAO75569 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKRAO75569 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKRAO75569 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKRAO75569 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKRAO75569 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKRAO75569 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKRAO75569 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKRAO75569 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKRAO75569 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKRAO75569 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKRAO75569 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKRAO75569 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKRAO75569 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKRAO75569 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKRAO75569 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKRAO75569 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKRAO75569 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKRAO75569 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKRAO75569 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKRAO75569 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKRAO75569 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKRAO75569 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKRAO75569 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKRAO75569 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKRAO75569 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKRAO75569 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKRAO75569 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKRAO75569 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKRAO75569 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKRAO75569 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKRAO75569 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKRAO75569 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKRAO75569 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKRAO75569 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKRAO75569 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKRAO75569 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKRAO75569 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKRAO75569 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKRAO75569 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKRAO75569 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKRAO75569 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKRAO75569 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKRAO75569 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKRAO75569 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKRAO75569 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRKRAO75569 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKRAO75569 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKRAO75569 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKRAO75569 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKRAO75569 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKRAO75569 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKRAO75569 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKRAO75569 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKRAO75569 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKRAO75569 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKRAO75569 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKRAO75569 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKRAO75569 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKRAO75569 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKRAO75569 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKRAO75569 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRKRAO75569 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRKRAO75569 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKRAO75569 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKRAO75569 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKRAO75569 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKRAO75569 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKRAO75569 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKRAO75569 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKRAO75569 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKRAO75569 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKRAO75569 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKRAO75569 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKRAO75569 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKRAO75569 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKRAO75569 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKRAO75569 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKRAO75569 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKRAO75569 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKRAO75569 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKRAO75569 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRKRAO75569 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKRAO75569 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKRAO75569 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKRAO75569 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKRAO75569 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKRAO75569 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKRAO75569 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKRAO75569 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKRAO75569 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKRAO75569 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKRAO75569 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKRAO75569 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKRAO75569 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKRAO75569 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKRAO75569 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKRAO75569 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.8 ms