Protein–RNA interactions for Protein: O75509

TNFRSF21, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 21, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF21O75509 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFRSF21O75509 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFRSF21O75509 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFRSF21O75509 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFRSF21O75509 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFRSF21O75509 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFRSF21O75509 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNFRSF21O75509 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNFRSF21O75509 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFRSF21O75509 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFRSF21O75509 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNFRSF21O75509 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNFRSF21O75509 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFRSF21O75509 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFRSF21O75509 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFRSF21O75509 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFRSF21O75509 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFRSF21O75509 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFRSF21O75509 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFRSF21O75509 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFRSF21O75509 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFRSF21O75509 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNFRSF21O75509 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFRSF21O75509 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFRSF21O75509 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFRSF21O75509 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFRSF21O75509 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFRSF21O75509 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFRSF21O75509 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFRSF21O75509 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFRSF21O75509 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFRSF21O75509 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFRSF21O75509 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFRSF21O75509 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFRSF21O75509 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFRSF21O75509 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFRSF21O75509 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFRSF21O75509 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFRSF21O75509 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFRSF21O75509 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFRSF21O75509 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFRSF21O75509 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFRSF21O75509 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFRSF21O75509 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFRSF21O75509 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFRSF21O75509 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFRSF21O75509 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFRSF21O75509 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFRSF21O75509 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFRSF21O75509 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFRSF21O75509 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFRSF21O75509 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFRSF21O75509 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFRSF21O75509 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFRSF21O75509 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFRSF21O75509 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFRSF21O75509 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFRSF21O75509 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFRSF21O75509 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFRSF21O75509 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFRSF21O75509 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFRSF21O75509 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFRSF21O75509 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFRSF21O75509 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFRSF21O75509 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFRSF21O75509 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFRSF21O75509 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TNFRSF21O75509 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TNFRSF21O75509 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFRSF21O75509 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFRSF21O75509 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFRSF21O75509 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFRSF21O75509 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFRSF21O75509 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFRSF21O75509 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF21O75509 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF21O75509 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF21O75509 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF21O75509 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF21O75509 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF21O75509 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF21O75509 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF21O75509 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF21O75509 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF21O75509 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNFRSF21O75509 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNFRSF21O75509 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TNFRSF21O75509 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNFRSF21O75509 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNFRSF21O75509 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNFRSF21O75509 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNFRSF21O75509 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNFRSF21O75509 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TNFRSF21O75509 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNFRSF21O75509 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNFRSF21O75509 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNFRSF21O75509 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNFRSF21O75509 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNFRSF21O75509 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNFRSF21O75509 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms