Protein–RNA interactions for Protein: O75473

LGR5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR5O75473 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
LGR5O75473 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
LGR5O75473 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
LGR5O75473 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
LGR5O75473 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LGR5O75473 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LGR5O75473 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LGR5O75473 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LGR5O75473 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LGR5O75473 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LGR5O75473 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LGR5O75473 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LGR5O75473 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LGR5O75473 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LGR5O75473 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
LGR5O75473 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LGR5O75473 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LGR5O75473 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LGR5O75473 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LGR5O75473 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LGR5O75473 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LGR5O75473 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LGR5O75473 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LGR5O75473 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LGR5O75473 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LGR5O75473 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LGR5O75473 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LGR5O75473 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LGR5O75473 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LGR5O75473 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LGR5O75473 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
LGR5O75473 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LGR5O75473 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LGR5O75473 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LGR5O75473 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LGR5O75473 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LGR5O75473 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LGR5O75473 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LGR5O75473 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LGR5O75473 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LGR5O75473 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LGR5O75473 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LGR5O75473 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LGR5O75473 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LGR5O75473 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LGR5O75473 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LGR5O75473 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LGR5O75473 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LGR5O75473 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LGR5O75473 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
LGR5O75473 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
LGR5O75473 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LGR5O75473 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29■■■□□ 2.23
LGR5O75473 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LGR5O75473 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LGR5O75473 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LGR5O75473 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LGR5O75473 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LGR5O75473 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LGR5O75473 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LGR5O75473 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
LGR5O75473 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LGR5O75473 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LGR5O75473 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
LGR5O75473 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LGR5O75473 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LGR5O75473 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LGR5O75473 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LGR5O75473 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LGR5O75473 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LGR5O75473 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LGR5O75473 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LGR5O75473 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
LGR5O75473 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LGR5O75473 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LGR5O75473 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LGR5O75473 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LGR5O75473 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LGR5O75473 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LGR5O75473 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LGR5O75473 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LGR5O75473 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LGR5O75473 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LGR5O75473 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
LGR5O75473 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LGR5O75473 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LGR5O75473 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LGR5O75473 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LGR5O75473 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LGR5O75473 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LGR5O75473 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LGR5O75473 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LGR5O75473 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LGR5O75473 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LGR5O75473 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LGR5O75473 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LGR5O75473 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LGR5O75473 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LGR5O75473 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LGR5O75473 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms