Protein–RNA interactions for Protein: O75385

ULK1, Serine/threonine-protein kinase ULK1, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK1O75385 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ULK1O75385 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ULK1O75385 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ULK1O75385 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ULK1O75385 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ULK1O75385 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ULK1O75385 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ULK1O75385 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ULK1O75385 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ULK1O75385 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ULK1O75385 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ULK1O75385 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ULK1O75385 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ULK1O75385 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ULK1O75385 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ULK1O75385 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ULK1O75385 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ULK1O75385 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ULK1O75385 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ULK1O75385 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ULK1O75385 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ULK1O75385 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ULK1O75385 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ULK1O75385 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ULK1O75385 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ULK1O75385 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ULK1O75385 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ULK1O75385 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ULK1O75385 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ULK1O75385 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ULK1O75385 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ULK1O75385 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ULK1O75385 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ULK1O75385 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ULK1O75385 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ULK1O75385 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ULK1O75385 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ULK1O75385 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ULK1O75385 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ULK1O75385 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ULK1O75385 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ULK1O75385 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ULK1O75385 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ULK1O75385 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ULK1O75385 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ULK1O75385 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ULK1O75385 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ULK1O75385 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ULK1O75385 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ULK1O75385 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ULK1O75385 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ULK1O75385 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ULK1O75385 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ULK1O75385 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ULK1O75385 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ULK1O75385 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ULK1O75385 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ULK1O75385 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ULK1O75385 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ULK1O75385 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ULK1O75385 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ULK1O75385 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ULK1O75385 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ULK1O75385 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ULK1O75385 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ULK1O75385 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ULK1O75385 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ULK1O75385 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ULK1O75385 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ULK1O75385 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ULK1O75385 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ULK1O75385 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ULK1O75385 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ULK1O75385 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ULK1O75385 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ULK1O75385 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ULK1O75385 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ULK1O75385 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ULK1O75385 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ULK1O75385 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ULK1O75385 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ULK1O75385 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ULK1O75385 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ULK1O75385 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ULK1O75385 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ULK1O75385 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ULK1O75385 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ULK1O75385 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ULK1O75385 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ULK1O75385 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ULK1O75385 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ULK1O75385 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ULK1O75385 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ULK1O75385 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ULK1O75385 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ULK1O75385 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ULK1O75385 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ULK1O75385 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ULK1O75385 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ULK1O75385 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms