Protein–RNA interactions for Protein: O60760

HPGDS, Hematopoietic prostaglandin D synthase, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDSO60760 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HPGDSO60760 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HPGDSO60760 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HPGDSO60760 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HPGDSO60760 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HPGDSO60760 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HPGDSO60760 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HPGDSO60760 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HPGDSO60760 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HPGDSO60760 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HPGDSO60760 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HPGDSO60760 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HPGDSO60760 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HPGDSO60760 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HPGDSO60760 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HPGDSO60760 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HPGDSO60760 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HPGDSO60760 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HPGDSO60760 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPGDSO60760 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPGDSO60760 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPGDSO60760 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPGDSO60760 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HPGDSO60760 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HPGDSO60760 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HPGDSO60760 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HPGDSO60760 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HPGDSO60760 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPGDSO60760 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPGDSO60760 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPGDSO60760 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPGDSO60760 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HPGDSO60760 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HPGDSO60760 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HPGDSO60760 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HPGDSO60760 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HPGDSO60760 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPGDSO60760 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPGDSO60760 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPGDSO60760 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPGDSO60760 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HPGDSO60760 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPGDSO60760 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPGDSO60760 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPGDSO60760 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPGDSO60760 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPGDSO60760 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPGDSO60760 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HPGDSO60760 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPGDSO60760 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPGDSO60760 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPGDSO60760 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPGDSO60760 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPGDSO60760 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPGDSO60760 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPGDSO60760 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPGDSO60760 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPGDSO60760 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HPGDSO60760 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPGDSO60760 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPGDSO60760 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPGDSO60760 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPGDSO60760 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPGDSO60760 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPGDSO60760 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPGDSO60760 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPGDSO60760 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPGDSO60760 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPGDSO60760 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPGDSO60760 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPGDSO60760 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPGDSO60760 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPGDSO60760 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPGDSO60760 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPGDSO60760 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPGDSO60760 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPGDSO60760 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPGDSO60760 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPGDSO60760 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPGDSO60760 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPGDSO60760 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HPGDSO60760 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HPGDSO60760 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HPGDSO60760 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HPGDSO60760 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HPGDSO60760 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HPGDSO60760 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPGDSO60760 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPGDSO60760 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HPGDSO60760 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HPGDSO60760 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HPGDSO60760 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPGDSO60760 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPGDSO60760 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPGDSO60760 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HPGDSO60760 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HPGDSO60760 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HPGDSO60760 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HPGDSO60760 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HPGDSO60760 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms