Protein–RNA interactions for Protein: O60759

CYTIP, Cytohesin-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTIPO60759 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYTIPO60759 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CYTIPO60759 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYTIPO60759 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYTIPO60759 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CYTIPO60759 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYTIPO60759 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYTIPO60759 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYTIPO60759 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CYTIPO60759 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CYTIPO60759 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CYTIPO60759 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYTIPO60759 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CYTIPO60759 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYTIPO60759 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYTIPO60759 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYTIPO60759 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYTIPO60759 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYTIPO60759 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CYTIPO60759 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYTIPO60759 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CYTIPO60759 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CYTIPO60759 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYTIPO60759 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYTIPO60759 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CYTIPO60759 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYTIPO60759 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CYTIPO60759 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYTIPO60759 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYTIPO60759 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CYTIPO60759 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYTIPO60759 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYTIPO60759 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYTIPO60759 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CYTIPO60759 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYTIPO60759 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYTIPO60759 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CYTIPO60759 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYTIPO60759 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYTIPO60759 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYTIPO60759 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CYTIPO60759 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYTIPO60759 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYTIPO60759 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CYTIPO60759 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYTIPO60759 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYTIPO60759 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYTIPO60759 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYTIPO60759 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CYTIPO60759 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYTIPO60759 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYTIPO60759 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYTIPO60759 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYTIPO60759 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYTIPO60759 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYTIPO60759 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYTIPO60759 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYTIPO60759 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYTIPO60759 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYTIPO60759 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYTIPO60759 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYTIPO60759 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYTIPO60759 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CYTIPO60759 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYTIPO60759 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYTIPO60759 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYTIPO60759 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYTIPO60759 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CYTIPO60759 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CYTIPO60759 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CYTIPO60759 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CYTIPO60759 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYTIPO60759 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CYTIPO60759 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CYTIPO60759 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYTIPO60759 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CYTIPO60759 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYTIPO60759 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYTIPO60759 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYTIPO60759 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYTIPO60759 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYTIPO60759 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYTIPO60759 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYTIPO60759 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYTIPO60759 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CYTIPO60759 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYTIPO60759 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYTIPO60759 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYTIPO60759 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYTIPO60759 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CYTIPO60759 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CYTIPO60759 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CYTIPO60759 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYTIPO60759 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYTIPO60759 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYTIPO60759 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYTIPO60759 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYTIPO60759 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYTIPO60759 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYTIPO60759 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.1 ms