Protein–RNA interactions for Protein: O60749

SNX2, Sorting nexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX2O60749 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX2O60749 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNX2O60749 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNX2O60749 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SNX2O60749 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX2O60749 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX2O60749 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX2O60749 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX2O60749 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNX2O60749 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SNX2O60749 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNX2O60749 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNX2O60749 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNX2O60749 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNX2O60749 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNX2O60749 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNX2O60749 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX2O60749 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX2O60749 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNX2O60749 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNX2O60749 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNX2O60749 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNX2O60749 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNX2O60749 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNX2O60749 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNX2O60749 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNX2O60749 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNX2O60749 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNX2O60749 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNX2O60749 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNX2O60749 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX2O60749 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX2O60749 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX2O60749 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX2O60749 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX2O60749 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX2O60749 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNX2O60749 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNX2O60749 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNX2O60749 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNX2O60749 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNX2O60749 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SNX2O60749 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNX2O60749 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNX2O60749 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNX2O60749 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNX2O60749 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNX2O60749 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNX2O60749 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNX2O60749 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNX2O60749 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNX2O60749 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNX2O60749 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNX2O60749 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX2O60749 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX2O60749 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX2O60749 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX2O60749 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX2O60749 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX2O60749 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX2O60749 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX2O60749 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX2O60749 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX2O60749 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNX2O60749 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX2O60749 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX2O60749 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX2O60749 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX2O60749 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX2O60749 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX2O60749 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNX2O60749 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNX2O60749 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNX2O60749 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNX2O60749 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX2O60749 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX2O60749 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX2O60749 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX2O60749 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX2O60749 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX2O60749 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX2O60749 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX2O60749 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNX2O60749 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX2O60749 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX2O60749 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX2O60749 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX2O60749 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX2O60749 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX2O60749 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX2O60749 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX2O60749 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX2O60749 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX2O60749 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX2O60749 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX2O60749 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX2O60749 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX2O60749 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX2O60749 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX2O60749 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms