Protein–RNA interactions for Protein: O60568

PLOD3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD3O60568 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLOD3O60568 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLOD3O60568 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PLOD3O60568 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLOD3O60568 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PLOD3O60568 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLOD3O60568 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLOD3O60568 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLOD3O60568 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PLOD3O60568 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLOD3O60568 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLOD3O60568 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLOD3O60568 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLOD3O60568 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLOD3O60568 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PLOD3O60568 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLOD3O60568 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLOD3O60568 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLOD3O60568 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLOD3O60568 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PLOD3O60568 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLOD3O60568 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLOD3O60568 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLOD3O60568 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLOD3O60568 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PLOD3O60568 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLOD3O60568 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLOD3O60568 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLOD3O60568 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLOD3O60568 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLOD3O60568 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLOD3O60568 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLOD3O60568 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PLOD3O60568 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLOD3O60568 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLOD3O60568 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLOD3O60568 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLOD3O60568 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLOD3O60568 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PLOD3O60568 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
PLOD3O60568 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLOD3O60568 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLOD3O60568 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLOD3O60568 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLOD3O60568 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLOD3O60568 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLOD3O60568 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLOD3O60568 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLOD3O60568 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLOD3O60568 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLOD3O60568 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLOD3O60568 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLOD3O60568 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLOD3O60568 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLOD3O60568 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLOD3O60568 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLOD3O60568 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PLOD3O60568 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PLOD3O60568 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PLOD3O60568 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PLOD3O60568 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PLOD3O60568 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PLOD3O60568 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLOD3O60568 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLOD3O60568 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLOD3O60568 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLOD3O60568 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PLOD3O60568 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLOD3O60568 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLOD3O60568 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLOD3O60568 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLOD3O60568 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PLOD3O60568 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PLOD3O60568 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PLOD3O60568 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLOD3O60568 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLOD3O60568 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLOD3O60568 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLOD3O60568 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLOD3O60568 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLOD3O60568 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PLOD3O60568 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PLOD3O60568 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PLOD3O60568 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PLOD3O60568 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PLOD3O60568 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PLOD3O60568 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PLOD3O60568 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PLOD3O60568 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PLOD3O60568 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLOD3O60568 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLOD3O60568 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLOD3O60568 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLOD3O60568 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLOD3O60568 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLOD3O60568 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLOD3O60568 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLOD3O60568 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLOD3O60568 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLOD3O60568 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms