Protein–RNA interactions for Protein: O60493

SNX3, Sorting nexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX3O60493 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX3O60493 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX3O60493 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX3O60493 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX3O60493 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNX3O60493 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNX3O60493 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNX3O60493 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX3O60493 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX3O60493 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX3O60493 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX3O60493 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX3O60493 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX3O60493 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNX3O60493 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNX3O60493 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNX3O60493 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SNX3O60493 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX3O60493 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX3O60493 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX3O60493 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX3O60493 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX3O60493 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX3O60493 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX3O60493 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX3O60493 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX3O60493 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX3O60493 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX3O60493 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX3O60493 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX3O60493 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX3O60493 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX3O60493 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX3O60493 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX3O60493 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX3O60493 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX3O60493 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX3O60493 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX3O60493 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX3O60493 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNX3O60493 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNX3O60493 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SNX3O60493 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SNX3O60493 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX3O60493 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX3O60493 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX3O60493 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX3O60493 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX3O60493 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX3O60493 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX3O60493 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX3O60493 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX3O60493 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX3O60493 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX3O60493 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX3O60493 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX3O60493 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX3O60493 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX3O60493 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX3O60493 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX3O60493 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX3O60493 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX3O60493 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX3O60493 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX3O60493 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX3O60493 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX3O60493 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX3O60493 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX3O60493 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNX3O60493 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX3O60493 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX3O60493 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX3O60493 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX3O60493 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX3O60493 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNX3O60493 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNX3O60493 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNX3O60493 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SNX3O60493 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX3O60493 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX3O60493 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX3O60493 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX3O60493 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX3O60493 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX3O60493 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX3O60493 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX3O60493 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX3O60493 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNX3O60493 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNX3O60493 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNX3O60493 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX3O60493 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX3O60493 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX3O60493 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX3O60493 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX3O60493 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX3O60493 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX3O60493 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNX3O60493 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNX3O60493 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms