Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
GRIN3BO60391 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
GRIN3BO60391 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
GRIN3BO60391 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
GRIN3BO60391 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
GRIN3BO60391 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
GRIN3BO60391 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
GRIN3BO60391 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
GRIN3BO60391 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
GRIN3BO60391 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
GRIN3BO60391 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
GRIN3BO60391 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
GRIN3BO60391 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
GRIN3BO60391 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
GRIN3BO60391 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
GRIN3BO60391 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
GRIN3BO60391 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
GRIN3BO60391 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
GRIN3BO60391 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
GRIN3BO60391 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
GRIN3BO60391 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
GRIN3BO60391 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
GRIN3BO60391 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
GRIN3BO60391 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
GRIN3BO60391 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
GRIN3BO60391 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
GRIN3BO60391 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
GRIN3BO60391 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
GRIN3BO60391 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
GRIN3BO60391 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
GRIN3BO60391 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
GRIN3BO60391 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.59■■■□□ 2.81
GRIN3BO60391 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
GRIN3BO60391 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC32.57■■■□□ 2.81
GRIN3BO60391 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
GRIN3BO60391 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
GRIN3BO60391 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
GRIN3BO60391 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
GRIN3BO60391 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
GRIN3BO60391 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
GRIN3BO60391 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
GRIN3BO60391 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
GRIN3BO60391 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
GRIN3BO60391 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
GRIN3BO60391 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
GRIN3BO60391 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
GRIN3BO60391 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
GRIN3BO60391 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
GRIN3BO60391 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
GRIN3BO60391 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
GRIN3BO60391 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
GRIN3BO60391 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
GRIN3BO60391 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
GRIN3BO60391 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
GRIN3BO60391 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
GRIN3BO60391 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
GRIN3BO60391 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
GRIN3BO60391 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.78
GRIN3BO60391 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
GRIN3BO60391 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
GRIN3BO60391 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
GRIN3BO60391 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
GRIN3BO60391 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
GRIN3BO60391 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
GRIN3BO60391 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
GRIN3BO60391 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
GRIN3BO60391 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
GRIN3BO60391 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
GRIN3BO60391 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
GRIN3BO60391 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
GRIN3BO60391 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
GRIN3BO60391 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
GRIN3BO60391 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
GRIN3BO60391 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
GRIN3BO60391 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
GRIN3BO60391 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
GRIN3BO60391 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC32.39■■■□□ 2.78
GRIN3BO60391 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
GRIN3BO60391 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
GRIN3BO60391 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
GRIN3BO60391 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
GRIN3BO60391 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
GRIN3BO60391 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
GRIN3BO60391 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
GRIN3BO60391 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
GRIN3BO60391 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
GRIN3BO60391 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
GRIN3BO60391 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
GRIN3BO60391 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
GRIN3BO60391 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
GRIN3BO60391 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
GRIN3BO60391 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
GRIN3BO60391 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
GRIN3BO60391 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
GRIN3BO60391 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
GRIN3BO60391 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
GRIN3BO60391 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC32.3■■■□□ 2.76
GRIN3BO60391 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
GRIN3BO60391 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
GRIN3BO60391 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms