Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TRAK2O60296 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TRAK2O60296 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TRAK2O60296 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TRAK2O60296 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TRAK2O60296 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TRAK2O60296 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TRAK2O60296 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TRAK2O60296 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TRAK2O60296 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TRAK2O60296 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TRAK2O60296 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TRAK2O60296 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TRAK2O60296 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TRAK2O60296 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TRAK2O60296 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
TRAK2O60296 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TRAK2O60296 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TRAK2O60296 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
TRAK2O60296 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TRAK2O60296 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TRAK2O60296 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TRAK2O60296 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
TRAK2O60296 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
TRAK2O60296 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TRAK2O60296 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TRAK2O60296 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
TRAK2O60296 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
TRAK2O60296 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
TRAK2O60296 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
TRAK2O60296 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
TRAK2O60296 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TRAK2O60296 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TRAK2O60296 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TRAK2O60296 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TRAK2O60296 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TRAK2O60296 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TRAK2O60296 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TRAK2O60296 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TRAK2O60296 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TRAK2O60296 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TRAK2O60296 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TRAK2O60296 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TRAK2O60296 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TRAK2O60296 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
TRAK2O60296 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TRAK2O60296 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TRAK2O60296 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TRAK2O60296 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TRAK2O60296 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TRAK2O60296 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TRAK2O60296 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TRAK2O60296 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TRAK2O60296 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TRAK2O60296 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TRAK2O60296 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
TRAK2O60296 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TRAK2O60296 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TRAK2O60296 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TRAK2O60296 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
TRAK2O60296 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TRAK2O60296 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TRAK2O60296 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRAK2O60296 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TRAK2O60296 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TRAK2O60296 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRAK2O60296 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
TRAK2O60296 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRAK2O60296 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
TRAK2O60296 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TRAK2O60296 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TRAK2O60296 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
TRAK2O60296 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRAK2O60296 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRAK2O60296 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRAK2O60296 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRAK2O60296 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRAK2O60296 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRAK2O60296 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRAK2O60296 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRAK2O60296 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TRAK2O60296 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRAK2O60296 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRAK2O60296 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRAK2O60296 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRAK2O60296 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TRAK2O60296 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TRAK2O60296 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TRAK2O60296 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TRAK2O60296 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TRAK2O60296 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TRAK2O60296 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TRAK2O60296 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TRAK2O60296 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TRAK2O60296 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TRAK2O60296 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TRAK2O60296 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TRAK2O60296 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TRAK2O60296 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TRAK2O60296 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.8 ms