Protein–RNA interactions for Protein: O43852

CALU, Calumenin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALUO43852 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CALUO43852 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CALUO43852 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CALUO43852 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CALUO43852 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CALUO43852 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CALUO43852 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CALUO43852 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CALUO43852 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CALUO43852 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CALUO43852 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CALUO43852 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CALUO43852 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CALUO43852 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CALUO43852 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CALUO43852 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CALUO43852 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CALUO43852 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CALUO43852 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CALUO43852 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CALUO43852 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CALUO43852 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CALUO43852 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CALUO43852 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CALUO43852 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CALUO43852 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CALUO43852 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CALUO43852 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CALUO43852 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CALUO43852 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CALUO43852 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CALUO43852 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CALUO43852 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CALUO43852 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CALUO43852 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CALUO43852 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CALUO43852 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CALUO43852 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CALUO43852 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CALUO43852 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CALUO43852 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CALUO43852 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CALUO43852 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CALUO43852 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CALUO43852 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CALUO43852 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CALUO43852 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CALUO43852 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CALUO43852 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CALUO43852 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CALUO43852 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CALUO43852 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CALUO43852 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CALUO43852 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CALUO43852 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CALUO43852 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CALUO43852 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CALUO43852 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CALUO43852 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CALUO43852 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CALUO43852 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CALUO43852 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CALUO43852 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CALUO43852 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CALUO43852 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CALUO43852 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
CALUO43852 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CALUO43852 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CALUO43852 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CALUO43852 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CALUO43852 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CALUO43852 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CALUO43852 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CALUO43852 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CALUO43852 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CALUO43852 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CALUO43852 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CALUO43852 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CALUO43852 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CALUO43852 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CALUO43852 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CALUO43852 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CALUO43852 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CALUO43852 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CALUO43852 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CALUO43852 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CALUO43852 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CALUO43852 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CALUO43852 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CALUO43852 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CALUO43852 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CALUO43852 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CALUO43852 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CALUO43852 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CALUO43852 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CALUO43852 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CALUO43852 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CALUO43852 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CALUO43852 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CALUO43852 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms