Protein–RNA interactions for Protein: O43707

ACTN4, Alpha-actinin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4O43707 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ACTN4O43707 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ACTN4O43707 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ACTN4O43707 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
ACTN4O43707 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ACTN4O43707 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ACTN4O43707 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ACTN4O43707 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ACTN4O43707 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ACTN4O43707 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ACTN4O43707 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ACTN4O43707 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ACTN4O43707 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ACTN4O43707 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ACTN4O43707 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ACTN4O43707 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ACTN4O43707 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ACTN4O43707 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ACTN4O43707 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ACTN4O43707 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ACTN4O43707 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ACTN4O43707 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ACTN4O43707 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ACTN4O43707 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ACTN4O43707 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ACTN4O43707 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ACTN4O43707 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ACTN4O43707 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ACTN4O43707 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ACTN4O43707 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ACTN4O43707 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ACTN4O43707 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
ACTN4O43707 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ACTN4O43707 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ACTN4O43707 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ACTN4O43707 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ACTN4O43707 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ACTN4O43707 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ACTN4O43707 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ACTN4O43707 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ACTN4O43707 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ACTN4O43707 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ACTN4O43707 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ACTN4O43707 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ACTN4O43707 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ACTN4O43707 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ACTN4O43707 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ACTN4O43707 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ACTN4O43707 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ACTN4O43707 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ACTN4O43707 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ACTN4O43707 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
ACTN4O43707 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ACTN4O43707 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ACTN4O43707 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ACTN4O43707 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ACTN4O43707 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
ACTN4O43707 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ACTN4O43707 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ACTN4O43707 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ACTN4O43707 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ACTN4O43707 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ACTN4O43707 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ACTN4O43707 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ACTN4O43707 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ACTN4O43707 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ACTN4O43707 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ACTN4O43707 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ACTN4O43707 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ACTN4O43707 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ACTN4O43707 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ACTN4O43707 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ACTN4O43707 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ACTN4O43707 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ACTN4O43707 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ACTN4O43707 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ACTN4O43707 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ACTN4O43707 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ACTN4O43707 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ACTN4O43707 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ACTN4O43707 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ACTN4O43707 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ACTN4O43707 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ACTN4O43707 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ACTN4O43707 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ACTN4O43707 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ACTN4O43707 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ACTN4O43707 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
ACTN4O43707 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ACTN4O43707 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ACTN4O43707 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ACTN4O43707 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ACTN4O43707 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ACTN4O43707 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ACTN4O43707 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ACTN4O43707 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ACTN4O43707 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ACTN4O43707 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ACTN4O43707 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ACTN4O43707 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms