Protein–RNA interactions for Protein: O43657

TSPAN6, Tetraspanin-6, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN6O43657 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSPAN6O43657 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSPAN6O43657 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSPAN6O43657 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TSPAN6O43657 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TSPAN6O43657 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TSPAN6O43657 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSPAN6O43657 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSPAN6O43657 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TSPAN6O43657 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSPAN6O43657 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSPAN6O43657 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSPAN6O43657 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSPAN6O43657 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSPAN6O43657 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSPAN6O43657 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSPAN6O43657 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSPAN6O43657 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSPAN6O43657 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TSPAN6O43657 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TSPAN6O43657 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TSPAN6O43657 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TSPAN6O43657 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TSPAN6O43657 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TSPAN6O43657 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TSPAN6O43657 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TSPAN6O43657 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TSPAN6O43657 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TSPAN6O43657 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TSPAN6O43657 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TSPAN6O43657 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TSPAN6O43657 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TSPAN6O43657 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TSPAN6O43657 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TSPAN6O43657 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TSPAN6O43657 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TSPAN6O43657 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TSPAN6O43657 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TSPAN6O43657 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TSPAN6O43657 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TSPAN6O43657 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TSPAN6O43657 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TSPAN6O43657 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TSPAN6O43657 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TSPAN6O43657 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TSPAN6O43657 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TSPAN6O43657 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TSPAN6O43657 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TSPAN6O43657 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TSPAN6O43657 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TSPAN6O43657 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TSPAN6O43657 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TSPAN6O43657 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TSPAN6O43657 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TSPAN6O43657 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TSPAN6O43657 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TSPAN6O43657 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TSPAN6O43657 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TSPAN6O43657 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TSPAN6O43657 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TSPAN6O43657 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TSPAN6O43657 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TSPAN6O43657 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TSPAN6O43657 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TSPAN6O43657 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TSPAN6O43657 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TSPAN6O43657 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TSPAN6O43657 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TSPAN6O43657 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TSPAN6O43657 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TSPAN6O43657 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TSPAN6O43657 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
TSPAN6O43657 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TSPAN6O43657 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TSPAN6O43657 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TSPAN6O43657 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TSPAN6O43657 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TSPAN6O43657 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TSPAN6O43657 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TSPAN6O43657 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TSPAN6O43657 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TSPAN6O43657 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TSPAN6O43657 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TSPAN6O43657 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TSPAN6O43657 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TSPAN6O43657 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TSPAN6O43657 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TSPAN6O43657 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TSPAN6O43657 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TSPAN6O43657 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TSPAN6O43657 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TSPAN6O43657 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TSPAN6O43657 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TSPAN6O43657 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TSPAN6O43657 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TSPAN6O43657 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TSPAN6O43657 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TSPAN6O43657 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TSPAN6O43657 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TSPAN6O43657 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms