Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HTRA2O43464 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HTRA2O43464 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
HTRA2O43464 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HTRA2O43464 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HTRA2O43464 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HTRA2O43464 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HTRA2O43464 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HTRA2O43464 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HTRA2O43464 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HTRA2O43464 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HTRA2O43464 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HTRA2O43464 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HTRA2O43464 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HTRA2O43464 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HTRA2O43464 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HTRA2O43464 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HTRA2O43464 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HTRA2O43464 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
HTRA2O43464 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HTRA2O43464 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HTRA2O43464 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HTRA2O43464 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HTRA2O43464 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HTRA2O43464 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HTRA2O43464 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HTRA2O43464 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HTRA2O43464 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HTRA2O43464 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HTRA2O43464 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HTRA2O43464 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HTRA2O43464 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HTRA2O43464 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HTRA2O43464 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HTRA2O43464 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HTRA2O43464 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HTRA2O43464 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HTRA2O43464 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HTRA2O43464 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HTRA2O43464 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HTRA2O43464 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HTRA2O43464 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HTRA2O43464 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HTRA2O43464 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HTRA2O43464 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
HTRA2O43464 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HTRA2O43464 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
HTRA2O43464 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HTRA2O43464 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HTRA2O43464 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HTRA2O43464 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
HTRA2O43464 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HTRA2O43464 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HTRA2O43464 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HTRA2O43464 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HTRA2O43464 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HTRA2O43464 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HTRA2O43464 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HTRA2O43464 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HTRA2O43464 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HTRA2O43464 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HTRA2O43464 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HTRA2O43464 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HTRA2O43464 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HTRA2O43464 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HTRA2O43464 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HTRA2O43464 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HTRA2O43464 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HTRA2O43464 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HTRA2O43464 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HTRA2O43464 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HTRA2O43464 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HTRA2O43464 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HTRA2O43464 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HTRA2O43464 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HTRA2O43464 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HTRA2O43464 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
HTRA2O43464 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
HTRA2O43464 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HTRA2O43464 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HTRA2O43464 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HTRA2O43464 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HTRA2O43464 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HTRA2O43464 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HTRA2O43464 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HTRA2O43464 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HTRA2O43464 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HTRA2O43464 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HTRA2O43464 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HTRA2O43464 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26■■□□□ 1.75
HTRA2O43464 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HTRA2O43464 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HTRA2O43464 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HTRA2O43464 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HTRA2O43464 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HTRA2O43464 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HTRA2O43464 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HTRA2O43464 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HTRA2O43464 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
HTRA2O43464 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms