Protein–RNA interactions for Protein: O43257

ZNHIT1, Zinc finger HIT domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT1O43257 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNHIT1O43257 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNHIT1O43257 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNHIT1O43257 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNHIT1O43257 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNHIT1O43257 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNHIT1O43257 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNHIT1O43257 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNHIT1O43257 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNHIT1O43257 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNHIT1O43257 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNHIT1O43257 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNHIT1O43257 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNHIT1O43257 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNHIT1O43257 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNHIT1O43257 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNHIT1O43257 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNHIT1O43257 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNHIT1O43257 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNHIT1O43257 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNHIT1O43257 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNHIT1O43257 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNHIT1O43257 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNHIT1O43257 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNHIT1O43257 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNHIT1O43257 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNHIT1O43257 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNHIT1O43257 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNHIT1O43257 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNHIT1O43257 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNHIT1O43257 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNHIT1O43257 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNHIT1O43257 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNHIT1O43257 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNHIT1O43257 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNHIT1O43257 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNHIT1O43257 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNHIT1O43257 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNHIT1O43257 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNHIT1O43257 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNHIT1O43257 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZNHIT1O43257 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNHIT1O43257 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNHIT1O43257 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNHIT1O43257 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNHIT1O43257 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNHIT1O43257 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNHIT1O43257 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNHIT1O43257 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNHIT1O43257 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNHIT1O43257 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNHIT1O43257 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNHIT1O43257 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNHIT1O43257 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNHIT1O43257 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNHIT1O43257 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNHIT1O43257 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNHIT1O43257 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNHIT1O43257 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNHIT1O43257 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNHIT1O43257 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNHIT1O43257 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNHIT1O43257 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNHIT1O43257 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNHIT1O43257 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNHIT1O43257 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNHIT1O43257 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNHIT1O43257 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNHIT1O43257 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNHIT1O43257 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNHIT1O43257 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNHIT1O43257 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNHIT1O43257 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNHIT1O43257 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNHIT1O43257 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNHIT1O43257 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNHIT1O43257 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNHIT1O43257 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNHIT1O43257 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNHIT1O43257 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNHIT1O43257 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNHIT1O43257 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNHIT1O43257 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNHIT1O43257 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNHIT1O43257 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNHIT1O43257 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNHIT1O43257 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNHIT1O43257 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNHIT1O43257 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNHIT1O43257 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNHIT1O43257 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNHIT1O43257 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNHIT1O43257 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNHIT1O43257 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNHIT1O43257 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNHIT1O43257 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNHIT1O43257 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNHIT1O43257 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNHIT1O43257 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNHIT1O43257 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms