Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLOCKO15516 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLOCKO15516 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLOCKO15516 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLOCKO15516 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLOCKO15516 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLOCKO15516 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLOCKO15516 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLOCKO15516 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLOCKO15516 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLOCKO15516 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLOCKO15516 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLOCKO15516 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLOCKO15516 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLOCKO15516 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLOCKO15516 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLOCKO15516 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLOCKO15516 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLOCKO15516 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLOCKO15516 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLOCKO15516 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLOCKO15516 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLOCKO15516 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLOCKO15516 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLOCKO15516 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLOCKO15516 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLOCKO15516 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLOCKO15516 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLOCKO15516 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLOCKO15516 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLOCKO15516 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLOCKO15516 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLOCKO15516 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CLOCKO15516 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLOCKO15516 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLOCKO15516 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLOCKO15516 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLOCKO15516 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLOCKO15516 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLOCKO15516 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLOCKO15516 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLOCKO15516 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLOCKO15516 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLOCKO15516 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLOCKO15516 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLOCKO15516 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLOCKO15516 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLOCKO15516 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLOCKO15516 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLOCKO15516 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLOCKO15516 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLOCKO15516 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLOCKO15516 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLOCKO15516 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLOCKO15516 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLOCKO15516 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLOCKO15516 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLOCKO15516 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLOCKO15516 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLOCKO15516 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLOCKO15516 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLOCKO15516 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLOCKO15516 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLOCKO15516 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLOCKO15516 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLOCKO15516 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLOCKO15516 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLOCKO15516 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLOCKO15516 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLOCKO15516 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLOCKO15516 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLOCKO15516 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLOCKO15516 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLOCKO15516 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLOCKO15516 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLOCKO15516 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLOCKO15516 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLOCKO15516 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLOCKO15516 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLOCKO15516 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLOCKO15516 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLOCKO15516 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CLOCKO15516 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLOCKO15516 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLOCKO15516 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLOCKO15516 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLOCKO15516 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLOCKO15516 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLOCKO15516 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLOCKO15516 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLOCKO15516 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLOCKO15516 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLOCKO15516 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLOCKO15516 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLOCKO15516 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CLOCKO15516 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CLOCKO15516 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLOCKO15516 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLOCKO15516 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLOCKO15516 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms