Protein–RNA interactions for Protein: O15335

CHAD, Chondroadherin, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHADO15335 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CHADO15335 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHADO15335 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHADO15335 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHADO15335 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHADO15335 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHADO15335 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHADO15335 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHADO15335 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHADO15335 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHADO15335 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHADO15335 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHADO15335 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHADO15335 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHADO15335 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHADO15335 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHADO15335 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHADO15335 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHADO15335 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHADO15335 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHADO15335 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHADO15335 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CHADO15335 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHADO15335 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHADO15335 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHADO15335 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHADO15335 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHADO15335 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHADO15335 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CHADO15335 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHADO15335 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHADO15335 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHADO15335 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHADO15335 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHADO15335 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHADO15335 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHADO15335 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHADO15335 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHADO15335 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHADO15335 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHADO15335 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHADO15335 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHADO15335 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHADO15335 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHADO15335 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHADO15335 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHADO15335 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHADO15335 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHADO15335 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHADO15335 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHADO15335 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHADO15335 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHADO15335 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHADO15335 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHADO15335 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHADO15335 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHADO15335 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CHADO15335 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHADO15335 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHADO15335 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CHADO15335 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CHADO15335 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CHADO15335 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CHADO15335 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CHADO15335 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CHADO15335 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CHADO15335 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CHADO15335 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CHADO15335 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHADO15335 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHADO15335 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHADO15335 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHADO15335 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CHADO15335 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHADO15335 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHADO15335 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHADO15335 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHADO15335 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHADO15335 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHADO15335 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHADO15335 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHADO15335 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHADO15335 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHADO15335 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CHADO15335 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHADO15335 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHADO15335 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHADO15335 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHADO15335 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHADO15335 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHADO15335 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHADO15335 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHADO15335 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHADO15335 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHADO15335 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHADO15335 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHADO15335 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CHADO15335 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHADO15335 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CHADO15335 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms