Protein–RNA interactions for Protein: O15335

CHAD, Chondroadherin, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHADO15335 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CHADO15335 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHADO15335 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHADO15335 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHADO15335 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHADO15335 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHADO15335 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHADO15335 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHADO15335 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHADO15335 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHADO15335 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHADO15335 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHADO15335 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHADO15335 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHADO15335 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHADO15335 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHADO15335 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHADO15335 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHADO15335 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHADO15335 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHADO15335 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHADO15335 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CHADO15335 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHADO15335 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHADO15335 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHADO15335 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHADO15335 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHADO15335 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHADO15335 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CHADO15335 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHADO15335 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHADO15335 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHADO15335 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHADO15335 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHADO15335 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHADO15335 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHADO15335 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHADO15335 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHADO15335 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHADO15335 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHADO15335 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHADO15335 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHADO15335 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHADO15335 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHADO15335 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHADO15335 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHADO15335 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHADO15335 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHADO15335 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHADO15335 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHADO15335 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHADO15335 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHADO15335 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHADO15335 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHADO15335 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHADO15335 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHADO15335 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CHADO15335 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHADO15335 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHADO15335 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CHADO15335 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CHADO15335 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CHADO15335 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CHADO15335 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CHADO15335 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CHADO15335 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CHADO15335 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CHADO15335 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CHADO15335 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHADO15335 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHADO15335 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHADO15335 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHADO15335 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CHADO15335 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHADO15335 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHADO15335 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHADO15335 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHADO15335 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHADO15335 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHADO15335 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHADO15335 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHADO15335 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHADO15335 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHADO15335 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CHADO15335 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHADO15335 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHADO15335 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHADO15335 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHADO15335 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHADO15335 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHADO15335 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHADO15335 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHADO15335 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHADO15335 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHADO15335 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHADO15335 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHADO15335 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CHADO15335 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHADO15335 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CHADO15335 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms