Protein–RNA interactions for Protein: O14618

CCS, Copper chaperone for superoxide dismutase, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSO14618 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCSO14618 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCSO14618 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCSO14618 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCSO14618 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCSO14618 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCSO14618 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCSO14618 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCSO14618 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCSO14618 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCSO14618 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCSO14618 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCSO14618 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCSO14618 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCSO14618 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCSO14618 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCSO14618 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCSO14618 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCSO14618 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCSO14618 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCSO14618 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCSO14618 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCSO14618 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCSO14618 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCSO14618 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCSO14618 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCSO14618 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCSO14618 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCSO14618 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCSO14618 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCSO14618 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCSO14618 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCSO14618 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCSO14618 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCSO14618 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCSO14618 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCSO14618 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCSO14618 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCSO14618 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCSO14618 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCSO14618 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCSO14618 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCSO14618 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCSO14618 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCSO14618 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCSO14618 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCSO14618 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCSO14618 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCSO14618 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCSO14618 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCSO14618 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCSO14618 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCSO14618 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCSO14618 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCSO14618 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCSO14618 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCSO14618 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCSO14618 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCSO14618 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCSO14618 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCSO14618 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCSO14618 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCSO14618 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCSO14618 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCSO14618 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCSO14618 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCSO14618 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCSO14618 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCSO14618 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCSO14618 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCSO14618 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCSO14618 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCSO14618 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCSO14618 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCSO14618 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCSO14618 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCSO14618 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCSO14618 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCSO14618 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCSO14618 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCSO14618 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCSO14618 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCSO14618 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCSO14618 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCSO14618 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCSO14618 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCSO14618 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCSO14618 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCSO14618 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCSO14618 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCSO14618 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCSO14618 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCSO14618 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCSO14618 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCSO14618 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCSO14618 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCSO14618 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCSO14618 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCSO14618 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCSO14618 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms