Protein–RNA interactions for Protein: O14544

SOCS6, Suppressor of cytokine signaling 6, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS6O14544 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SOCS6O14544 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SOCS6O14544 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SOCS6O14544 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SOCS6O14544 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SOCS6O14544 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SOCS6O14544 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SOCS6O14544 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SOCS6O14544 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SOCS6O14544 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SOCS6O14544 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SOCS6O14544 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SOCS6O14544 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SOCS6O14544 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SOCS6O14544 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SOCS6O14544 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SOCS6O14544 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SOCS6O14544 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SOCS6O14544 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SOCS6O14544 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SOCS6O14544 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SOCS6O14544 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SOCS6O14544 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SOCS6O14544 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SOCS6O14544 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SOCS6O14544 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SOCS6O14544 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SOCS6O14544 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SOCS6O14544 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SOCS6O14544 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SOCS6O14544 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SOCS6O14544 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SOCS6O14544 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SOCS6O14544 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SOCS6O14544 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SOCS6O14544 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SOCS6O14544 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SOCS6O14544 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SOCS6O14544 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SOCS6O14544 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SOCS6O14544 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SOCS6O14544 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SOCS6O14544 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SOCS6O14544 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SOCS6O14544 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SOCS6O14544 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SOCS6O14544 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SOCS6O14544 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SOCS6O14544 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SOCS6O14544 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SOCS6O14544 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SOCS6O14544 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SOCS6O14544 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SOCS6O14544 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SOCS6O14544 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SOCS6O14544 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SOCS6O14544 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SOCS6O14544 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SOCS6O14544 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SOCS6O14544 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SOCS6O14544 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SOCS6O14544 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SOCS6O14544 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SOCS6O14544 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SOCS6O14544 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SOCS6O14544 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SOCS6O14544 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SOCS6O14544 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SOCS6O14544 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SOCS6O14544 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SOCS6O14544 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SOCS6O14544 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SOCS6O14544 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SOCS6O14544 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SOCS6O14544 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SOCS6O14544 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SOCS6O14544 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SOCS6O14544 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SOCS6O14544 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SOCS6O14544 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SOCS6O14544 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SOCS6O14544 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SOCS6O14544 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SOCS6O14544 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SOCS6O14544 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SOCS6O14544 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SOCS6O14544 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SOCS6O14544 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SOCS6O14544 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SOCS6O14544 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SOCS6O14544 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SOCS6O14544 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SOCS6O14544 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SOCS6O14544 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SOCS6O14544 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SOCS6O14544 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOCS6O14544 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOCS6O14544 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SOCS6O14544 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOCS6O14544 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms