Protein–RNA interactions for Protein: O00421

CCRL2, C-C chemokine receptor-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCRL2O00421 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCRL2O00421 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCRL2O00421 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCRL2O00421 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCRL2O00421 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCRL2O00421 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCRL2O00421 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCRL2O00421 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCRL2O00421 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCRL2O00421 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCRL2O00421 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCRL2O00421 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCRL2O00421 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCRL2O00421 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCRL2O00421 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCRL2O00421 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCRL2O00421 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCRL2O00421 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCRL2O00421 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCRL2O00421 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCRL2O00421 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCRL2O00421 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCRL2O00421 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCRL2O00421 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCRL2O00421 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCRL2O00421 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCRL2O00421 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCRL2O00421 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCRL2O00421 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCRL2O00421 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCRL2O00421 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCRL2O00421 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCRL2O00421 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCRL2O00421 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCRL2O00421 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCRL2O00421 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCRL2O00421 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCRL2O00421 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCRL2O00421 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCRL2O00421 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCRL2O00421 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCRL2O00421 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCRL2O00421 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCRL2O00421 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCRL2O00421 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCRL2O00421 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCRL2O00421 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCRL2O00421 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCRL2O00421 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCRL2O00421 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCRL2O00421 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCRL2O00421 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCRL2O00421 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCRL2O00421 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCRL2O00421 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCRL2O00421 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCRL2O00421 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCRL2O00421 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCRL2O00421 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCRL2O00421 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCRL2O00421 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCRL2O00421 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCRL2O00421 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCRL2O00421 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCRL2O00421 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCRL2O00421 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCRL2O00421 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCRL2O00421 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCRL2O00421 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCRL2O00421 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCRL2O00421 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCRL2O00421 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCRL2O00421 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCRL2O00421 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCRL2O00421 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCRL2O00421 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCRL2O00421 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCRL2O00421 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCRL2O00421 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCRL2O00421 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCRL2O00421 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCRL2O00421 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCRL2O00421 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCRL2O00421 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCRL2O00421 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCRL2O00421 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCRL2O00421 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCRL2O00421 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCRL2O00421 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCRL2O00421 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCRL2O00421 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCRL2O00421 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCRL2O00421 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCRL2O00421 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCRL2O00421 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCRL2O00421 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCRL2O00421 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCRL2O00421 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCRL2O00421 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCRL2O00421 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms