Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
O00370 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
O00370 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
O00370 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
O00370 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
O00370 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
O00370 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
O00370 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
O00370 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
O00370 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
O00370 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
O00370 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
O00370 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
O00370 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
O00370 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
O00370 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
O00370 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
O00370 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
O00370 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
O00370 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
O00370 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
O00370 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
O00370 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
O00370 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
O00370 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
O00370 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
O00370 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
O00370 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
O00370 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
O00370 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
O00370 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
O00370 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
O00370 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
O00370 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
O00370 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
O00370 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
O00370 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
O00370 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
O00370 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
O00370 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
O00370 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
O00370 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
O00370 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
O00370 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
O00370 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.54■■■□□ 2
O00370 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
O00370 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
O00370 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
O00370 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
O00370 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
O00370 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
O00370 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
O00370 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
O00370 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
O00370 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
O00370 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
O00370 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
O00370 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
O00370 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
O00370 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
O00370 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
O00370 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
O00370 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
O00370 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
O00370 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
O00370 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
O00370 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
O00370 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
O00370 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
O00370 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
O00370 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
O00370 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
O00370 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
O00370 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
O00370 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
O00370 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
O00370 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
O00370 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
O00370 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
O00370 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
O00370 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
O00370 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
O00370 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
O00370 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
O00370 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
O00370 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
O00370 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
O00370 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
O00370 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
O00370 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
O00370 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
O00370 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
O00370 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
O00370 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
O00370 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
O00370 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
O00370 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
O00370 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
O00370 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
O00370 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.5 ms