Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SNAP23O00161 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SNAP23O00161 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SNAP23O00161 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SNAP23O00161 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SNAP23O00161 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
SNAP23O00161 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
SNAP23O00161 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
SNAP23O00161 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SNAP23O00161 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SNAP23O00161 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SNAP23O00161 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SNAP23O00161 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SNAP23O00161 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SNAP23O00161 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SNAP23O00161 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SNAP23O00161 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SNAP23O00161 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SNAP23O00161 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SNAP23O00161 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SNAP23O00161 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SNAP23O00161 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SNAP23O00161 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SNAP23O00161 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
SNAP23O00161 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SNAP23O00161 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SNAP23O00161 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SNAP23O00161 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
SNAP23O00161 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SNAP23O00161 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SNAP23O00161 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
SNAP23O00161 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SNAP23O00161 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SNAP23O00161 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SNAP23O00161 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SNAP23O00161 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SNAP23O00161 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
SNAP23O00161 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
SNAP23O00161 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
SNAP23O00161 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
SNAP23O00161 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
SNAP23O00161 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
SNAP23O00161 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
SNAP23O00161 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
SNAP23O00161 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
SNAP23O00161 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
SNAP23O00161 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
SNAP23O00161 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
SNAP23O00161 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
SNAP23O00161 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
SNAP23O00161 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
SNAP23O00161 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
SNAP23O00161 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
SNAP23O00161 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
SNAP23O00161 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
SNAP23O00161 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
SNAP23O00161 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
SNAP23O00161 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
SNAP23O00161 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
SNAP23O00161 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
SNAP23O00161 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
SNAP23O00161 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
SNAP23O00161 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
SNAP23O00161 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
SNAP23O00161 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
SNAP23O00161 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
SNAP23O00161 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
SNAP23O00161 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
SNAP23O00161 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
SNAP23O00161 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.83■■■□□ 2.69
SNAP23O00161 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
SNAP23O00161 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
SNAP23O00161 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
SNAP23O00161 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
SNAP23O00161 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
SNAP23O00161 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
SNAP23O00161 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
SNAP23O00161 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
SNAP23O00161 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
SNAP23O00161 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
SNAP23O00161 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
SNAP23O00161 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
SNAP23O00161 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
SNAP23O00161 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
SNAP23O00161 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
SNAP23O00161 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
SNAP23O00161 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
SNAP23O00161 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
SNAP23O00161 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SNAP23O00161 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
SNAP23O00161 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
SNAP23O00161 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
SNAP23O00161 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SNAP23O00161 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SNAP23O00161 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SNAP23O00161 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SNAP23O00161 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SNAP23O00161 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SNAP23O00161 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SNAP23O00161 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms