Protein–RNA interactions for Protein: H3BU86

STX16-NPEPL1, STX16-NPEPL1 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX16-NPEPL1H3BU86 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
STX16-NPEPL1H3BU86 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
STX16-NPEPL1H3BU86 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
STX16-NPEPL1H3BU86 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
STX16-NPEPL1H3BU86 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
STX16-NPEPL1H3BU86 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
STX16-NPEPL1H3BU86 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
STX16-NPEPL1H3BU86 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
STX16-NPEPL1H3BU86 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
STX16-NPEPL1H3BU86 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
STX16-NPEPL1H3BU86 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
STX16-NPEPL1H3BU86 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
STX16-NPEPL1H3BU86 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
STX16-NPEPL1H3BU86 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
STX16-NPEPL1H3BU86 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STX16-NPEPL1H3BU86 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STX16-NPEPL1H3BU86 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STX16-NPEPL1H3BU86 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
STX16-NPEPL1H3BU86 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
STX16-NPEPL1H3BU86 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STX16-NPEPL1H3BU86 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
STX16-NPEPL1H3BU86 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
STX16-NPEPL1H3BU86 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
STX16-NPEPL1H3BU86 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
STX16-NPEPL1H3BU86 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STX16-NPEPL1H3BU86 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STX16-NPEPL1H3BU86 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
STX16-NPEPL1H3BU86 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
STX16-NPEPL1H3BU86 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
STX16-NPEPL1H3BU86 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
STX16-NPEPL1H3BU86 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
STX16-NPEPL1H3BU86 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STX16-NPEPL1H3BU86 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
STX16-NPEPL1H3BU86 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
STX16-NPEPL1H3BU86 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
STX16-NPEPL1H3BU86 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
STX16-NPEPL1H3BU86 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STX16-NPEPL1H3BU86 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
STX16-NPEPL1H3BU86 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STX16-NPEPL1H3BU86 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STX16-NPEPL1H3BU86 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STX16-NPEPL1H3BU86 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
STX16-NPEPL1H3BU86 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
STX16-NPEPL1H3BU86 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STX16-NPEPL1H3BU86 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
STX16-NPEPL1H3BU86 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STX16-NPEPL1H3BU86 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STX16-NPEPL1H3BU86 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STX16-NPEPL1H3BU86 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STX16-NPEPL1H3BU86 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STX16-NPEPL1H3BU86 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STX16-NPEPL1H3BU86 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STX16-NPEPL1H3BU86 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
STX16-NPEPL1H3BU86 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STX16-NPEPL1H3BU86 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STX16-NPEPL1H3BU86 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STX16-NPEPL1H3BU86 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STX16-NPEPL1H3BU86 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STX16-NPEPL1H3BU86 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STX16-NPEPL1H3BU86 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STX16-NPEPL1H3BU86 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STX16-NPEPL1H3BU86 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STX16-NPEPL1H3BU86 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
STX16-NPEPL1H3BU86 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
STX16-NPEPL1H3BU86 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
STX16-NPEPL1H3BU86 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
STX16-NPEPL1H3BU86 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
STX16-NPEPL1H3BU86 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
STX16-NPEPL1H3BU86 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
STX16-NPEPL1H3BU86 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
STX16-NPEPL1H3BU86 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
STX16-NPEPL1H3BU86 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
STX16-NPEPL1H3BU86 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
STX16-NPEPL1H3BU86 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
STX16-NPEPL1H3BU86 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
STX16-NPEPL1H3BU86 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
STX16-NPEPL1H3BU86 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
STX16-NPEPL1H3BU86 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
STX16-NPEPL1H3BU86 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
STX16-NPEPL1H3BU86 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
STX16-NPEPL1H3BU86 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
STX16-NPEPL1H3BU86 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
STX16-NPEPL1H3BU86 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
STX16-NPEPL1H3BU86 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
STX16-NPEPL1H3BU86 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
STX16-NPEPL1H3BU86 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
STX16-NPEPL1H3BU86 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
STX16-NPEPL1H3BU86 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
STX16-NPEPL1H3BU86 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
STX16-NPEPL1H3BU86 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
STX16-NPEPL1H3BU86 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
STX16-NPEPL1H3BU86 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
STX16-NPEPL1H3BU86 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
STX16-NPEPL1H3BU86 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
STX16-NPEPL1H3BU86 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
STX16-NPEPL1H3BU86 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
STX16-NPEPL1H3BU86 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
STX16-NPEPL1H3BU86 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
STX16-NPEPL1H3BU86 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
STX16-NPEPL1H3BU86 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms