Protein–RNA interactions for Protein: F8VWA3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8VWA3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
F8VWA3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
F8VWA3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
F8VWA3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
F8VWA3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
F8VWA3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
F8VWA3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
F8VWA3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
F8VWA3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
F8VWA3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
F8VWA3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
F8VWA3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
F8VWA3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
F8VWA3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
F8VWA3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
F8VWA3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
F8VWA3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
F8VWA3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
F8VWA3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
F8VWA3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
F8VWA3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
F8VWA3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
F8VWA3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
F8VWA3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
F8VWA3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
F8VWA3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
F8VWA3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
F8VWA3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
F8VWA3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
F8VWA3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
F8VWA3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
F8VWA3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
F8VWA3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
F8VWA3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
F8VWA3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
F8VWA3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
F8VWA3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
F8VWA3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
F8VWA3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
F8VWA3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
F8VWA3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
F8VWA3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
F8VWA3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
F8VWA3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
F8VWA3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
F8VWA3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
F8VWA3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
F8VWA3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
F8VWA3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
F8VWA3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
F8VWA3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
F8VWA3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
F8VWA3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
F8VWA3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
F8VWA3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
F8VWA3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
F8VWA3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
F8VWA3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
F8VWA3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
F8VWA3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
F8VWA3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
F8VWA3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
F8VWA3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
F8VWA3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
F8VWA3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
F8VWA3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
F8VWA3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
F8VWA3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
F8VWA3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
F8VWA3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
F8VWA3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
F8VWA3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
F8VWA3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
F8VWA3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
F8VWA3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
F8VWA3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
F8VWA3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
F8VWA3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
F8VWA3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
F8VWA3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
F8VWA3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
F8VWA3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
F8VWA3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
F8VWA3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
F8VWA3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
F8VWA3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
F8VWA3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
F8VWA3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
F8VWA3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
F8VWA3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
F8VWA3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
F8VWA3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
F8VWA3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
F8VWA3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
F8VWA3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
F8VWA3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
F8VWA3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
F8VWA3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
F8VWA3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
F8VWA3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms