Protein–RNA interactions for Protein: F8VVB4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8VVB4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
F8VVB4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
F8VVB4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
F8VVB4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
F8VVB4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
F8VVB4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
F8VVB4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
F8VVB4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
F8VVB4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
F8VVB4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
F8VVB4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
F8VVB4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
F8VVB4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
F8VVB4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
F8VVB4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
F8VVB4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
F8VVB4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
F8VVB4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
F8VVB4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
F8VVB4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
F8VVB4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
F8VVB4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
F8VVB4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
F8VVB4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
F8VVB4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
F8VVB4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
F8VVB4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
F8VVB4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
F8VVB4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
F8VVB4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
F8VVB4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
F8VVB4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
F8VVB4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
F8VVB4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
F8VVB4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
F8VVB4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
F8VVB4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
F8VVB4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
F8VVB4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
F8VVB4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
F8VVB4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
F8VVB4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
F8VVB4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
F8VVB4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
F8VVB4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
F8VVB4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
F8VVB4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
F8VVB4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
F8VVB4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
F8VVB4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
F8VVB4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
F8VVB4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
F8VVB4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
F8VVB4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
F8VVB4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
F8VVB4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
F8VVB4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
F8VVB4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
F8VVB4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
F8VVB4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
F8VVB4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
F8VVB4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
F8VVB4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
F8VVB4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
F8VVB4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
F8VVB4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
F8VVB4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
F8VVB4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
F8VVB4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
F8VVB4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
F8VVB4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
F8VVB4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
F8VVB4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
F8VVB4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
F8VVB4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
F8VVB4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
F8VVB4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
F8VVB4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
F8VVB4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
F8VVB4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
F8VVB4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
F8VVB4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
F8VVB4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
F8VVB4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
F8VVB4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
F8VVB4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
F8VVB4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
F8VVB4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
F8VVB4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
F8VVB4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
F8VVB4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
F8VVB4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
F8VVB4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
F8VVB4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
F8VVB4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
F8VVB4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
F8VVB4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
F8VVB4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
F8VVB4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
F8VVB4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms