Protein–RNA interactions for Protein: D6REC4

CFAP99, Cilia- and flagella-associated protein 99, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP99D6REC4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP99D6REC4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP99D6REC4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP99D6REC4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP99D6REC4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP99D6REC4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP99D6REC4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP99D6REC4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP99D6REC4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP99D6REC4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP99D6REC4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP99D6REC4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP99D6REC4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP99D6REC4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP99D6REC4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP99D6REC4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP99D6REC4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CFAP99D6REC4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CFAP99D6REC4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CFAP99D6REC4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CFAP99D6REC4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CFAP99D6REC4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CFAP99D6REC4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CFAP99D6REC4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CFAP99D6REC4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CFAP99D6REC4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CFAP99D6REC4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CFAP99D6REC4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CFAP99D6REC4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CFAP99D6REC4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CFAP99D6REC4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CFAP99D6REC4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CFAP99D6REC4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CFAP99D6REC4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CFAP99D6REC4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CFAP99D6REC4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFAP99D6REC4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFAP99D6REC4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CFAP99D6REC4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CFAP99D6REC4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CFAP99D6REC4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFAP99D6REC4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CFAP99D6REC4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CFAP99D6REC4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFAP99D6REC4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFAP99D6REC4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFAP99D6REC4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFAP99D6REC4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFAP99D6REC4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFAP99D6REC4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFAP99D6REC4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFAP99D6REC4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFAP99D6REC4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFAP99D6REC4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFAP99D6REC4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFAP99D6REC4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFAP99D6REC4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFAP99D6REC4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFAP99D6REC4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFAP99D6REC4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFAP99D6REC4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CFAP99D6REC4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFAP99D6REC4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CFAP99D6REC4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFAP99D6REC4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CFAP99D6REC4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFAP99D6REC4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFAP99D6REC4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFAP99D6REC4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFAP99D6REC4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CFAP99D6REC4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFAP99D6REC4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFAP99D6REC4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFAP99D6REC4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFAP99D6REC4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFAP99D6REC4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFAP99D6REC4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFAP99D6REC4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFAP99D6REC4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CFAP99D6REC4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CFAP99D6REC4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CFAP99D6REC4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CFAP99D6REC4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CFAP99D6REC4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CFAP99D6REC4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CFAP99D6REC4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CFAP99D6REC4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CFAP99D6REC4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CFAP99D6REC4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CFAP99D6REC4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CFAP99D6REC4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CFAP99D6REC4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CFAP99D6REC4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CFAP99D6REC4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CFAP99D6REC4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CFAP99D6REC4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CFAP99D6REC4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFAP99D6REC4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFAP99D6REC4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFAP99D6REC4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms