Protein–RNA interactions for Protein: B4E171

Tetraspanin, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E171 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
B4E171 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
B4E171 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
B4E171 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
B4E171 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
B4E171 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
B4E171 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
B4E171 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
B4E171 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
B4E171 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
B4E171 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
B4E171 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
B4E171 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
B4E171 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
B4E171 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
B4E171 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
B4E171 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
B4E171 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
B4E171 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
B4E171 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
B4E171 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
B4E171 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
B4E171 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
B4E171 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
B4E171 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
B4E171 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
B4E171 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
B4E171 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
B4E171 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
B4E171 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
B4E171 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
B4E171 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
B4E171 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
B4E171 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
B4E171 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
B4E171 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
B4E171 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
B4E171 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
B4E171 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
B4E171 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
B4E171 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
B4E171 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
B4E171 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
B4E171 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
B4E171 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
B4E171 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
B4E171 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
B4E171 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
B4E171 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
B4E171 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
B4E171 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
B4E171 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
B4E171 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
B4E171 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
B4E171 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
B4E171 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
B4E171 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
B4E171 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
B4E171 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
B4E171 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
B4E171 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
B4E171 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
B4E171 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
B4E171 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
B4E171 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
B4E171 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
B4E171 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
B4E171 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
B4E171 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
B4E171 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
B4E171 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
B4E171 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
B4E171 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
B4E171 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
B4E171 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
B4E171 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
B4E171 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
B4E171 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
B4E171 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
B4E171 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
B4E171 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
B4E171 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
B4E171 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
B4E171 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
B4E171 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
B4E171 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
B4E171 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
B4E171 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
B4E171 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
B4E171 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
B4E171 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
B4E171 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
B4E171 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
B4E171 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
B4E171 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
B4E171 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
B4E171 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
B4E171 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
B4E171 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
B4E171 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms